270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0560 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  100 
 
 		 129 aa  264  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0669  hypothetical protein  41.51 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0653  hypothetical protein  41.51 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0624  CoA-binding domain protein  38.05 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1614  CoA-binding protein  37.17 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1655  CoA-binding protein  38.94 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000297514  normal  0.67582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4017  CoA-binding domain-containing protein  36.28 
 
 		 132 aa  84.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00796943  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1445  CoA-binding domain-containing protein  42.2 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1777  CoA-binding domain protein  38.53 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  37.61 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0698  hypothetical protein  34.55 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000671001  normal  0.0854698 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1359  CoA-binding domain-containing protein  42.39 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2600  CoA-binding domain protein  38.32 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00073882  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  37.17 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1327  CoA-binding domain-containing protein  40.22 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000352253  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0658  CoA-binding domain-containing protein  37 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00210865  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0217  CoA-binding protein  29.82 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0651  CoA-binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0019  hypothetical protein  34.23 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.816073  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0758  CoA-binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  39.78 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3507  CoA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684153  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1421  CoA-binding domain-containing protein  36.04 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000954781  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2880  hypothetical protein  35.96 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.476591  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1284  CoA-binding domain-containing protein  33.91 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0652  CoA-binding domain protein  34.86 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  37.74 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  34.71 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3784  CoA-binding domain-containing protein  32.41 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  34.45 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  48.61 
 
 		 699 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1412  hypothetical protein  30.56 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  33.62 
 
 		 198 aa  60.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0987  CoA-binding domain-containing protein  32.46 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3018  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  31.36 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0607  CoA-binding protein  34.23 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  36.21 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  27.93 
 
 		 537 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0363  hypothetical protein  24.79 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  35.59 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0863  hypothetical protein  44.16 
 
 		 707 aa  57.4  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0968097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2934  CoA-binding domain-containing protein  30.33 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  34.31 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  31.82 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  31.67 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  32.46 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  31.03 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  33.02 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  35.51 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  31.9 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0272  CoA-binding domain protein  33.64 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  30 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  39.74 
 
 		 701 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0966  CoA-binding domain protein  25.71 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7090  hypothetical protein  28.57 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8714  CoA-binding domain protein  36.99 
 
 		 722 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0725  CoA-binding domain-containing protein  35.35 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000455945 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  32.74 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  30 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  31.9 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1525  CoA-binding domain-containing protein  38.81 
 
 		 722 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_50959  predicted protein  33.94 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  30.19 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  35.71 
 
 		 700 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2358  CoA-binding domain-containing protein  32.2 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0319  CoA-binding domain protein  35.9 
 
 		 464 aa  53.9  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  32.2 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0886  CoA-binding domain protein  29.91 
 
 		 637 aa  53.5  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.330543  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  30.91 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0534  CoA-binding domain-containing protein  29.06 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  29.82 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  33.61 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4362  hypothetical protein  33.33 
 
 		 709 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.138782  normal  0.0457098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  29.82 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55314  predicted protein  28.91 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  32.2 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  29.82 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2075  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  30.58 
 
 		 612 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.313252  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  33.67 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  32.2 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  43.08 
 
 		 926 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  32.2 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1854  CoA-binding domain-containing protein  32.46 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0446458  normal  0.0146672 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  32.2 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1891  CoA-binding domain protein  29.91 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.272605 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  31.36 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  31.36 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  43.94 
 
 		 715 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  30.91 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  31.36 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  31.36 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  31.36 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3116  hypothetical protein  35.21 
 
 		 713 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0277399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1969  CoA-binding domain protein  41.27 
 
 		 680 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  28.95 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  25.93 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.338285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>