273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0986 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  100 
 
 		 271 aa  568  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  67.55 
 
 		 270 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  46.49 
 
 		 278 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  47.06 
 
 		 289 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  44.78 
 
 		 285 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  46.04 
 
 		 289 aa  235  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  43.01 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  44.07 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  41.22 
 
 		 277 aa  211  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3279  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  39.93 
 
 		 312 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  40.5 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  39.13 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  40.15 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  40.15 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  41.85 
 
 		 272 aa  205  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  40.07 
 
 		 282 aa  204  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.737071 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  40.15 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  40.15 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  40.15 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  38.79 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  38.32 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  40.15 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  40.15 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  40.15 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  38.71 
 
 		 277 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  40.51 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  38.35 
 
 		 277 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  38.6 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  38.6 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  38.6 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  40.22 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  38.35 
 
 		 291 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3893  Taurine dioxygenase  39.93 
 
 		 290 aa  198  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  38.69 
 
 		 283 aa  198  9e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  37.63 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  40.29 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  40.81 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  40.29 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2155  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase  38.35 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  40.49 
 
 		 315 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  39.93 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  39.38 
 
 		 315 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2101  Taurine dioxygenase  37.94 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5979  Taurine dioxygenase  38.25 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  38.81 
 
 		 282 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  38.7 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  40 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22390  Taurine dioxygenase protein  37.86 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  37.13 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5823  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  38.49 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  39 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3507  taurine dioxygenase  39 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220581 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  38.71 
 
 		 305 aa  188  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  38.35 
 
 		 297 aa  188  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.91 
 
 		 305 aa  188  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0112  taurine dioxygenase  38.7 
 
 		 315 aa  188  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  38.11 
 
 		 301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4383  Taurine dioxygenase  39.31 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3666  Taurine dioxygenase  36.94 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  39.93 
 
 		 273 aa  178  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  38.41 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2520  taurine dioxygenase  38.32 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02180  sulfonate dioxygenase, putative  38.66 
 
 		 388 aa  176  4e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450194  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  37.18 
 
 		 308 aa  175  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2520  dioxygenase, TauD/TfdA  38.32 
 
 		 292 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2573  dioxygenase, TauD/TfdA  38.32 
 
 		 292 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2135  dioxygenase, TauD/TfdA  38.32 
 
 		 292 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2661  dioxygenase, TauD/TfdA  38.32 
 
 		 292 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.719861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1409  dioxygenase, TauD/TfdA  38.32 
 
 		 292 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3179  dioxygenase, TauD/TfdA  38.32 
 
 		 292 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  38.13 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  37.5 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  38.75 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  36.46 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  36.69 
 
 		 299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.33 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1366  putative taurine dioxygenase, 2-oxoglutarate-dependent  35.64 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0715055 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1633  dioxygenase, TauD/TfdA  37.96 
 
 		 292 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02960  alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase (AFU_orthologue; AFUA_3G07960)  39.64 
 
 		 384 aa  171  7.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1958  dioxygenase, TauD/TfdA  37.96 
 
 		 292 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  37.73 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01960  conserved hypothetical protein  39.41 
 
 		 432 aa  170  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3261  taurine dioxygenase  35.87 
 
 		 286 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000698237  hitchhiker  0.000951887 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  34.91 
 
 		 280 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5119  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA (2-oxoglutarate-dependent)  37.18 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4704  taurine dioxygenase  39.25 
 
 		 282 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.84 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  37.05 
 
 		 299 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  37.05 
 
 		 299 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  36.64 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  35.97 
 
 		 316 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1665  taurine dioxygenase  36.46 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  35.88 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  35.64 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2006  taurine dioxygenase  36.43 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2175  taurine dioxygenase  36.73 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129597 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04108  conserved hypothetical protein  36.1 
 
 		 363 aa  165  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0021  taurine dioxygenase  37.18 
 
 		 299 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  36.29 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  36 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>