34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0636 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  100 
 
 		 127 aa  248  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5283  hypothetical protein  46.03 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.488524  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  48.62 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  42.37 
 
 		 123 aa  93.6  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 123 aa  86.7  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  48.15 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  46.75 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  50 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  43.52 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  50.82 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3535  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 103 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3807  hypothetical protein  43.02 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  47.22 
 
 		 103 aa  67  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  48.91 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  51.14 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 264 aa  57  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 264 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1480  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  47.27 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.695506 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1380  transcription regulator  33.7 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  43.08 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 		 263 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1457  putative transcriptional regulator, XRE family  34.95 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0521049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 109 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5585  hypothetical protein  43.64 
 
 		 60 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  36.17 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12056  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>