More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0328 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0328  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  100 
 
 
320 aa  617  1e-176  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1793  NADH dehydrogenase (quinone)  82.5 
 
 
320 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.096157  normal  0.688521 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2048  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  71.81 
 
 
324 aa  419  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.110372 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2275  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  72.78 
 
 
323 aa  420  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0754968  normal  0.291328 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0303  NADH dehydrogenase subunit H  41.38 
 
 
361 aa  251  9.000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.594505 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1301  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  37.5 
 
 
352 aa  212  7e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1898  NADH dehydrogenase subunit H  36.09 
 
 
352 aa  208  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180885  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1633  NADH dehydrogenase subunit H  40.06 
 
 
350 aa  207  2e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1082  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.45 
 
 
337 aa  205  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.524281  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0658  NADH dehydrogenase subunit H  39.3 
 
 
349 aa  202  8e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0515  NADH dehydrogenase subunit H  40.63 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0646  NADH dehydrogenase subunit H  38.68 
 
 
343 aa  181  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.411826  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.01 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  35.27 
 
 
333 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  34.78 
 
 
333 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0280  NADH dehydrogenase  32.77 
 
 
432 aa  159  8e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000247954 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.11 
 
 
349 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  32.76 
 
 
333 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1293  F420H2 dehydrogenase subunit H  33.33 
 
 
344 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000183992  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  33.11 
 
 
333 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  33.11 
 
 
333 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  33.11 
 
 
333 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  33.11 
 
 
333 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  33.11 
 
 
333 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  33.11 
 
 
333 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  33.11 
 
 
333 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  33.11 
 
 
333 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  33.45 
 
 
333 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  33.11 
 
 
333 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  31.66 
 
 
372 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  31.73 
 
 
372 aa  149  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  31.66 
 
 
372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  32.15 
 
 
372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  34.31 
 
 
349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.79 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  33.99 
 
 
349 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  30.87 
 
 
384 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  34.01 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  34.01 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  34.07 
 
 
372 aa  146  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  34.11 
 
 
353 aa  145  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.57 
 
 
343 aa  145  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  32.43 
 
 
328 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  34.11 
 
 
353 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  32.29 
 
 
438 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  33.56 
 
 
353 aa  143  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.15 
 
 
337 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  30.5 
 
 
372 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  32.42 
 
 
340 aa  142  7e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  32.42 
 
 
340 aa  142  7e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3819  NADH dehydrogenase (quinone)  36.21 
 
 
318 aa  142  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  31.45 
 
 
451 aa  142  8e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  29.9 
 
 
372 aa  142  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  31.92 
 
 
348 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  32.81 
 
 
447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.79 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  30.39 
 
 
384 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  30.39 
 
 
372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  30.72 
 
 
372 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2506  NADH dehydrogenase subunit H  32.62 
 
 
325 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2561  NADH dehydrogenase subunit H  32.62 
 
 
325 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2668  NADH dehydrogenase subunit H  32.62 
 
 
325 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  30.39 
 
 
372 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2550  NADH dehydrogenase subunit H  32.62 
 
 
325 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  31.72 
 
 
322 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2461  NADH dehydrogenase subunit H  32.62 
 
 
325 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  31.9 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  31.9 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  31.9 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  31.73 
 
 
372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  31.9 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  31.9 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  31.9 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  31.9 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  31.9 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  29.26 
 
 
372 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  32.26 
 
 
325 aa  139  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  32.58 
 
 
349 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.86 
 
 
344 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6087  NADH dehydrogenase subunit H  31.85 
 
 
462 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0085721  normal  0.0109132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  30.13 
 
 
372 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02167  hypothetical protein  32.22 
 
 
327 aa  138  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1039  NADH dehydrogenase subunit H  30.13 
 
 
372 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000216191 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0395  NADH dehydrogenase (quinone)  32 
 
 
433 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  29.53 
 
 
349 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3864  NADH dehydrogenase (quinone)  31.21 
 
 
390 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  32.39 
 
 
410 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  32.41 
 
 
357 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  34.16 
 
 
430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  31.31 
 
 
350 aa  135  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  31.29 
 
 
340 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.42 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2766  NADH dehydrogenase subunit H  31.54 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3302  NADH dehydrogenase subunit H  31.85 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1078  NADH dehydrogenase subunit H  32.89 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.425523 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0375  NADH-quinone oxidoreductase, chain H  32.62 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.45 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1012  NADH dehydrogenase subunit H  32.89 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1207  NADH dehydrogenase subunit H  32.89 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.01 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>