More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1884 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  100 
 
 		 163 aa  338  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2564  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 		 173 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 		 182 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2139  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  37.89 
 
 		 184 aa  103  8e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 318 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  32.68 
 
 		 362 aa  67.4  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  38.78 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.15 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  32.5 
 
 		 345 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.91 
 
 		 355 aa  64.7  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.83 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5608  cytidyltransferase-like protein  30.43 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400356 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.21 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  29.91 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.83 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.83 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.83 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.83 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.83 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  27.16 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  27.16 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  26.99 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  27.16 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  35 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  27.16 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  27.16 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  27.16 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  26.09 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  27.16 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  27.16 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  34.74 
 
 		 183 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  25.93 
 
 		 181 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  25.93 
 
 		 198 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0457  NADH pyrophosphatase  35.05 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159305 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0336  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0738056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0349  NADH pyrophosphatase  35.05 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3851  NADH pyrophosphatase  35.05 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  25.93 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0286  NADH pyrophosphatase  34.02 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0679  cytidyltransferase-related domain protein  31.78 
 
 		 344 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1137  NUDIX hydrolase  27.4 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.217943  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0701  cytidyltransferase-like protein  31.78 
 
 		 344 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.962082  normal  0.0273891 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  34.34 
 
 		 257 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  32.04 
 
 		 257 aa  57.8  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  34.34 
 
 		 257 aa  57.8  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  34.34 
 
 		 257 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  34.34 
 
 		 257 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  34.34 
 
 		 257 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 257 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  34.34 
 
 		 257 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  34.34 
 
 		 257 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3714  NADH pyrophosphatase  31.96 
 
 		 257 aa  57.8  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.506766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  34.34 
 
 		 257 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 181 aa  57.4  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 294 aa  57.4  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  30 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0218  NADH pyrophosphatase  30.93 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 		 341 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19860  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  29.37 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.526889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0974  cytidyltransferase-like protein  29.91 
 
 		 348 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  30.36 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  31.63 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  32.29 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  29.3 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  47.62 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0222  NADH pyrophosphatase  30.93 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740149  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  23.31 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  47.62 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  24.69 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  23.31 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  31.96 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2947  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  30.93 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1584  NAD(+) diphosphatase  30.07 
 
 		 330 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0238649  normal  0.338548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>