More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3331 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3331  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
697 aa  1428    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6973  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.41 
 
 
701 aa  580  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.846927  normal  0.0145645 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2746  cell division protein, penicillin-binding protein  40.34 
 
 
701 aa  549  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.777565  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1805  peptidoglycan glycosyltransferase  42.53 
 
 
669 aa  521  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667457  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06545  penicillin-binding protein  40.61 
 
 
662 aa  518  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0208895  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0595  hypothetical protein  38.68 
 
 
704 aa  499  1e-140  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4738  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.66 
 
 
709 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3521  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.03 
 
 
714 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681178  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1597  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.1 
 
 
651 aa  427  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0151645  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0575  penicillin-binding protein 2, putative  32.23 
 
 
733 aa  362  1e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.84 
 
 
689 aa  264  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.6 
 
 
680 aa  221  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  28.62 
 
 
684 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  28.02 
 
 
657 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.24 
 
 
673 aa  211  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.87 
 
 
670 aa  206  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.68 
 
 
657 aa  206  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.93 
 
 
582 aa  205  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  27.01 
 
 
723 aa  206  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 
631 aa  205  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  28.01 
 
 
673 aa  204  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  25.99 
 
 
713 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.07 
 
 
710 aa  200  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  27.43 
 
 
656 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  26.59 
 
 
657 aa  195  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.18 
 
 
654 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.8 
 
 
680 aa  190  7e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  26.39 
 
 
695 aa  190  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  26.9 
 
 
729 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  27.04 
 
 
660 aa  188  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.01 
 
 
614 aa  188  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  28.04 
 
 
682 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  29.17 
 
 
553 aa  181  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  25.67 
 
 
719 aa  180  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  26.02 
 
 
657 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.69 
 
 
662 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  27.63 
 
 
711 aa  179  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  25.52 
 
 
708 aa  178  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  28.99 
 
 
553 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  25.2 
 
 
734 aa  177  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  26.27 
 
 
727 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.1 
 
 
655 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.52 
 
 
703 aa  174  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0049  penicillin-binding protein 3  27.44 
 
 
663 aa  174  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0588264  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.64 
 
 
570 aa  173  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.45 
 
 
656 aa  173  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  25.36 
 
 
675 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  25.72 
 
 
727 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  25.52 
 
 
705 aa  172  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  25.52 
 
 
594 aa  171  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  28.24 
 
 
630 aa  172  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.27 
 
 
654 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.52 
 
 
594 aa  171  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  25.72 
 
 
728 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  28.24 
 
 
630 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  28.45 
 
 
727 aa  171  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  26.89 
 
 
653 aa  171  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  26.37 
 
 
649 aa  170  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  26.96 
 
 
690 aa  170  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  27.52 
 
 
618 aa  170  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1886  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.94 
 
 
736 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  26.94 
 
 
589 aa  169  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.635287  normal  0.182989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  27 
 
 
702 aa  170  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  25.27 
 
 
740 aa  169  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  26.85 
 
 
613 aa  169  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  27.63 
 
 
615 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  26.77 
 
 
649 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  27.35 
 
 
615 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.4 
 
 
645 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0866  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.73 
 
 
562 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.07417  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  27.35 
 
 
615 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  26.85 
 
 
613 aa  167  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  26.71 
 
 
615 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  27.11 
 
 
615 aa  167  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  27.6 
 
 
615 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  27.24 
 
 
580 aa  167  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  27 
 
 
721 aa  167  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  27.7 
 
 
616 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  27.3 
 
 
614 aa  167  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  27.3 
 
 
614 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  27.3 
 
 
614 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  27.3 
 
 
614 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  27.3 
 
 
614 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  27.3 
 
 
614 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  27.77 
 
 
631 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  27.3 
 
 
614 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  28.72 
 
 
632 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  28.72 
 
 
632 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  28.72 
 
 
632 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  26.82 
 
 
578 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  28.25 
 
 
553 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  25.33 
 
 
644 aa  165  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  26.56 
 
 
670 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  28.57 
 
 
594 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0370  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.46 
 
 
670 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  28.4 
 
 
596 aa  164  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  26.25 
 
 
580 aa  164  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  27.26 
 
 
614 aa  164  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  27.87 
 
 
594 aa  164  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  27.87 
 
 
594 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>