More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0656 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 
604 aa  1244    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33 
 
 
607 aa  300  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.89 
 
 
598 aa  296  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.49 
 
 
593 aa  293  7e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.77 
 
 
586 aa  287  4e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  33.71 
 
 
596 aa  280  5e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.09 
 
 
605 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  33.58 
 
 
601 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.44 
 
 
624 aa  259  9e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.06 
 
 
626 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.65 
 
 
610 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  29.48 
 
 
595 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  29.48 
 
 
595 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  32.03 
 
 
590 aa  252  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  31.34 
 
 
601 aa  250  7e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.84 
 
 
590 aa  248  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.83 
 
 
610 aa  237  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.53 
 
 
615 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  28.06 
 
 
618 aa  187  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.16 
 
 
597 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  28.96 
 
 
597 aa  163  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.82 
 
 
597 aa  154  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.13 
 
 
594 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.19 
 
 
554 aa  128  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  32.05 
 
 
243 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.73 
 
 
555 aa  117  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  29.89 
 
 
557 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.42 
 
 
558 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  35.1 
 
 
536 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  35.1 
 
 
536 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  28.52 
 
 
804 aa  99.4  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  35.38 
 
 
521 aa  99.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.02 
 
 
438 aa  99  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  32.41 
 
 
445 aa  98.2  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0622  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  41.96 
 
 
112 aa  97.4  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000499338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  34.87 
 
 
521 aa  97.4  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  23.69 
 
 
538 aa  95.5  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  31.05 
 
 
804 aa  94  7e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  31.88 
 
 
846 aa  91.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.63 
 
 
443 aa  91.3  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0119  DNA mismatch repair protein MutS  29.46 
 
 
931 aa  90.5  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.893903  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  29.78 
 
 
846 aa  90.5  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  30.43 
 
 
881 aa  90.1  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  31.38 
 
 
793 aa  89.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  30.29 
 
 
872 aa  87.8  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  31.11 
 
 
860 aa  86.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  28.76 
 
 
851 aa  87  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  30.4 
 
 
860 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  27.92 
 
 
854 aa  85.9  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  33.12 
 
 
793 aa  85.9  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  28.15 
 
 
893 aa  85.1  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  28.99 
 
 
956 aa  84.7  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  31.82 
 
 
896 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  27.93 
 
 
865 aa  84.3  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  27.78 
 
 
875 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  28.45 
 
 
873 aa  84  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01708  protein required for mismatch repair in mitosis and meiosis (Eurofung)  30.53 
 
 
1186 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  26.91 
 
 
930 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0366  DNA mismatch repair protein MutS  29.11 
 
 
914 aa  83.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0942134  normal  0.39879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  29.65 
 
 
868 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  27.78 
 
 
880 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0174  DNA mismatch repair protein MutS  28.51 
 
 
820 aa  82.8  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  29.69 
 
 
848 aa  82.8  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  32.09 
 
 
892 aa  82.4  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  27.88 
 
 
876 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.31 
 
 
437 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  32.09 
 
 
864 aa  82  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.79 
 
 
442 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  28.57 
 
 
859 aa  82  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  31.96 
 
 
883 aa  81.3  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2603  DNA mismatch repair protein MutS  32 
 
 
891 aa  81.6  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  30.29 
 
 
904 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  29.82 
 
 
864 aa  81.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  29.77 
 
 
882 aa  81.3  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  25.49 
 
 
917 aa  81.3  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  29 
 
 
868 aa  80.9  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  30.27 
 
 
897 aa  80.5  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1076  DNA mismatch repair protein MutS  31.19 
 
 
884 aa  80.5  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  32.34 
 
 
898 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  29.82 
 
 
882 aa  80.5  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  29.27 
 
 
870 aa  79.7  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  30.64 
 
 
900 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1166  DNA mismatch repair protein MutS  29.69 
 
 
863 aa  79.7  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.28 
 
 
450 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1537  DNA mismatch repair protein MutS  30.85 
 
 
880 aa  79.7  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  26.51 
 
 
918 aa  79.7  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  29.27 
 
 
870 aa  79.7  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  30.74 
 
 
855 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  30.92 
 
 
823 aa  79  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  29.28 
 
 
904 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  29.3 
 
 
848 aa  79.3  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  22.67 
 
 
855 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  22.67 
 
 
855 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01479  DNA-binding protein of the mitochondria (Eurofung)  31.22 
 
 
924 aa  78.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  31.35 
 
 
854 aa  79  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  30.68 
 
 
750 aa  78.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  28.37 
 
 
867 aa  78.6  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  29.19 
 
 
968 aa  78.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  29.87 
 
 
903 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1238  DNA mismatch repair protein MutS  28.26 
 
 
858 aa  78.6  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>