More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3348 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3348  cytochrome B561  100 
 
 		 183 aa  367  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.696433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  63.13 
 
 		 180 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  56.32 
 
 		 182 aa  192  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  59.55 
 
 		 181 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  58.01 
 
 		 182 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  56.91 
 
 		 182 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  58.43 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  57.87 
 
 		 181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  59.76 
 
 		 181 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  48.63 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  50.56 
 
 		 184 aa  158  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1333  cytochrome B561  51.74 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.666388  normal  0.933151 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  50.89 
 
 		 192 aa  152  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  47.19 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  43.09 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  42.7 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  42.53 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  43.1 
 
 		 183 aa  141  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  39.88 
 
 		 177 aa  127  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  42.35 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  38.73 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  39.55 
 
 		 176 aa  121  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  39.55 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  39.55 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  39.55 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  39.55 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01879  hypothetical protein  39.55 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  39.55 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1671  cytochrome B561  38.98 
 
 		 176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00739522  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  40 
 
 		 176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  38.98 
 
 		 180 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  39.41 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  39.41 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  38.82 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  38.82 
 
 		 176 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  37.65 
 
 		 177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1341  cytochrome B561  39.87 
 
 		 176 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.134025 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1928  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  39.87 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.27209  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2111  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  39.87 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.533814  hitchhiker  0.00078066 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1357  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  39.87 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0540712 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  41.18 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1372  nickel-dependent hydrogenase, B-type cytochrome subunit  39.87 
 
 		 176 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  38.51 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  35.84 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  35.84 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  35.84 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  38.37 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0932  cytochrome B561  37.57 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0972  cytochrome B561  41.57 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1755  cytochrome b561  41.99 
 
 		 188 aa  100  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000553481 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0475  putative cytochrome b561  34.81 
 
 		 178 aa  98.6  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.369041  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0425  putative cytochrome b561  34.81 
 
 		 178 aa  98.6  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  34.81 
 
 		 178 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2509  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  34.81 
 
 		 178 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1804  putative cytochrome b561  34.81 
 
 		 178 aa  98.6  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  35.43 
 
 		 179 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0823  cytochrome b561  34.81 
 
 		 225 aa  97.4  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.945704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  35.96 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0636  cytochrome b561, putative  35.36 
 
 		 229 aa  94.4  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3615  cytochrome B561  37.21 
 
 		 178 aa  91.3  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4454  cytochrome B561  37.21 
 
 		 178 aa  91.3  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3912  cytochrome B561  37.21 
 
 		 178 aa  91.3  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5657  cytochrome B561  34.27 
 
 		 190 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.998703 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3290  cytochrome B561  37.21 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3806  cytochrome B561  36.63 
 
 		 178 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.131783  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3256  cytochrome b561  35.84 
 
 		 176 aa  89  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4373  cytochrome B561  40 
 
 		 174 aa  88.2  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.454062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4505  cytochrome B561  40 
 
 		 174 aa  88.2  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0918  cytochrome b561  35.88 
 
 		 187 aa  87.8  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.974416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  36.36 
 
 		 186 aa  87.8  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2176  cytochrome B561  36.63 
 
 		 178 aa  87.4  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0739024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3279  cytochrome B561  34.29 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3390  cytochrome b561  34.68 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  33.92 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  31.84 
 
 		 196 aa  85.1  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  36.67 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  36.67 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  35.8 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  33.52 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  34.29 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  35.8 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  34.71 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  35.8 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  34.12 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  33.88 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  35.29 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  34.12 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1642  cytochrome b561  41.44 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1500  cytochrome b561  41.44 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1598  cytochrome b561  41.44 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01374  cytochrome b561  42.61 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782687  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2228  cytochrome B561  42.61 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.013498  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  31.25 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2023  cytochrome b561  42.61 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000362205 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1736  cytochrome B561  35.67 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0874237  normal  0.949544 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2241  cytochrome b561  42.61 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01386  hypothetical protein  42.61 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  35.56 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  33.53 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  32.18 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>