More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2273 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2273  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
171 aa  355  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  84.34 
 
 
171 aa  297  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0920408  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06848  acetyltransferase  46.15 
 
 
183 aa  159  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000873  putative acetyltransferase  47.9 
 
 
171 aa  155  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  43.03 
 
 
179 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 
179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  42.6 
 
 
178 aa  124  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  41.42 
 
 
178 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  40.24 
 
 
178 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1580  GCN5-related N-acetyltransferase  39.05 
 
 
178 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  40.24 
 
 
178 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
182 aa  121  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  40.24 
 
 
178 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  41.42 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121319  unclonable  0.0000303298 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  39.05 
 
 
178 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  40.24 
 
 
178 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  39.64 
 
 
178 aa  117  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2643  GCN5-related N-acetyltransferase  39.05 
 
 
177 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293381  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 
183 aa  104  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.152334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2618  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
178 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.397987  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000252712  hitchhiker  0.000932566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1263  acetyltransferase  34.52 
 
 
180 aa  88.2  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173592 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2854  GCN5-related N-acetyltransferase  29.65 
 
 
169 aa  79  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.931965  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2752  acetyltransferase  28.57 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5249  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000080  putative acetyltransferase  31.55 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.241329  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  27.11 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0548  acetyltransferase  24.53 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  32.21 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2123  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0562469  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05693  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.76 
 
 
169 aa  62  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6345  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
174 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.881821  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3043  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
196 aa  61.2  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5418  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
164 aa  61.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.192124  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3568  acetyltransferase-like protein  27.89 
 
 
195 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  24.26 
 
 
204 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329985  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1743  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
167 aa  58.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  25.6 
 
 
176 aa  58.2  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  31.08 
 
 
171 aa  58.2  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1833  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
194 aa  57.4  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0482  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
194 aa  57.4  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15117  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  25.32 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2997  acetyltransferase-like protein  22.22 
 
 
218 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  26.79 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  26.23 
 
 
180 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2254  GCN5-related N-acetyltransferase  27.11 
 
 
190 aa  57  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0706618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5603  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.40665  normal  0.677013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1733  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.94 
 
 
167 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110114 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4697  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  normal  0.278503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3405  GCN5-related N-acetyltransferase  26.04 
 
 
194 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000780456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3536  acetyltransferase  29.56 
 
 
167 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1894  GCN5-related N-acetyltransferase  28.1 
 
 
168 aa  55.1  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1733  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
176 aa  54.7  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.321693  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1374  GCN5-related N-acetyltransferase  25.6 
 
 
187 aa  54.3  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
197 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00275714  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  25.44 
 
 
194 aa  54.3  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324183  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1868  acetyltransferase, GNAT family  30.61 
 
 
176 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  25.44 
 
 
194 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2570  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345636  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3269  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3937  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
177 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0592305  normal  0.264283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1047  GCN5-related N-acetyltransferase  24.85 
 
 
194 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000813755  hitchhiker  0.000000247911 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0622  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
194 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
196 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 
170 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  24.57 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  28.05 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0425  hypothetical protein  43.24 
 
 
195 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1803  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2859  acetyltransferase, GNAT family  24.7 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464219 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3474  acetyltransferase, GNAT family  29.93 
 
 
176 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4367  GCN5-related N-acetyltransferase  29.65 
 
 
187 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1058  hypothetical protein  31.82 
 
 
166 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0999  GCN5-related N-acetyltransferase  25.88 
 
 
197 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303176  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3879  GCN5-related N-acetyltransferase  28.98 
 
 
176 aa  52.4  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332564  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3593  GCN5-related N-acetyltransferase  29.58 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
183 aa  52  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.215241  normal  0.0203096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3483  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
188 aa  52  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000185806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0544  hypothetical protein  22.64 
 
 
201 aa  52  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
175 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 
205 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 
187 aa  51.6  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0946  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
147 aa  51.6  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0163773  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1312  GCN5-related N-acetyltransferase  27.82 
 
 
189 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0167578  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2382  acetyltransferase  25.62 
 
 
194 aa  51.2  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0441  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
202 aa  51.2  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
165 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
165 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1738  acetyltransferase  29.45 
 
 
176 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1911  acetyltransferase, GNAT family  29.45 
 
 
176 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.138005 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1714  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.45 
 
 
176 aa  51.2  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000230477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1876  acetyltransferase  29.45 
 
 
176 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4082  GCN5-related N-acetyltransferase  28.22 
 
 
174 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1117  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
183 aa  50.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123993  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3517  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.5 
 
 
167 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3114  acetyltransferase  24.36 
 
 
168 aa  50.8  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>