More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3597 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3597  peptide chain release factor-like protein  100 
 
 		 207 aa  425  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3439  peptide chain release factor-like protein  93.72 
 
 		 207 aa  388  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0349  peptide chain release factor-like protein  63.86 
 
 		 204 aa  268  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0345  peptide chain release factor-like protein  63.86 
 
 		 204 aa  268  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0354  peptide chain release factor-like protein  63.86 
 
 		 204 aa  268  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0356  peptide chain release factor-like protein  63.37 
 
 		 204 aa  266  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000967755 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0263  peptide chain release factor-like protein  63.68 
 
 		 204 aa  266  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0364  peptide chain release factor-like protein  63.37 
 
 		 204 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.429875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0233  peptide chain release factor-like protein  63.68 
 
 		 204 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0268  peptide chain release factor-like protein  63.68 
 
 		 204 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0290  peptide chain release factor-like protein  62.69 
 
 		 204 aa  263  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127156 
 
 
-
 
NC_003296  RS01750  peptide chain release factor-like protein  58.21 
 
 		 207 aa  223  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.132154  normal  0.46874 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3371  peptide chain release factor H  62.35 
 
 		 178 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00231  peptide chain release factor 2  63.8 
 
 		 166 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00234  hypothetical protein  63.8 
 
 		 166 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72200  peptide chain release factor-like protein  59.2 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0281  peptide chain release factor-like protein  61.96 
 
 		 166 aa  214  9e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.568314 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4861  peptide chain release factor-like protein  51.24 
 
 		 204 aa  201  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0755731 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3902  peptide chain release factor H  44.04 
 
 		 218 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0189567 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2459  peptide chain release factor H  45.81 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321859  normal  0.956081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3456  peptide chain release factor-like protein  37.8 
 
 		 229 aa  160  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0652118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0332  putative peptide chain release factor  40 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0242  peptide chain release factor-like protein  41.09 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2039  class I peptide chain release factor  38.66 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7272  peptide chain release factor-like protein  34.3 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000014386  normal  0.97905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3282  peptide chain release factor H  37.81 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434629  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0760  peptide chain release factor H  35.32 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1124  class I peptide chain release factor domain-containing protein  46.5 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  34.62 
 
 		 330 aa  96.3  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1562  peptide chain release factor 2  33.52 
 
 		 280 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271557  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  34.55 
 
 		 367 aa  92.8  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  32.74 
 
 		 417 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  33.33 
 
 		 363 aa  92.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  32.4 
 
 		 359 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  34.2 
 
 		 367 aa  92  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  32.4 
 
 		 349 aa  92  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  31.88 
 
 		 357 aa  91.7  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  31.06 
 
 		 372 aa  91.7  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  31.4 
 
 		 331 aa  91.7  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2027  peptide chain release factor 2  32.4 
 
 		 248 aa  91.7  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  32.37 
 
 		 366 aa  91.3  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  32.4 
 
 		 406 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  31.88 
 
 		 362 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  32.14 
 
 		 367 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0194  peptide chain release factor 2  34.29 
 
 		 299 aa  89.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.109294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2722  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  31.84 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3112  peptide chain release factor 2  31.84 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826864  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  35.43 
 
 		 349 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  30.86 
 
 		 391 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  35 
 
 		 365 aa  90.1  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  30.86 
 
 		 391 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1153  peptide chain release factor 2  31.84 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449488  normal  0.0907567 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  35.8 
 
 		 375 aa  89.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  30.86 
 
 		 391 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1479  peptide chain release factor 2, programmed  31.84 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  30.86 
 
 		 391 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  32.58 
 
 		 375 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  32.14 
 
 		 367 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2206  peptide chain release factor 2, programmed  31.84 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  32.14 
 
 		 300 aa  89.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004438  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 260 aa  89.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  31.84 
 
 		 367 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  31.84 
 
 		 367 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  31.55 
 
 		 357 aa  89.4  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  31.84 
 
 		 367 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00959  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  89.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  31.74 
 
 		 376 aa  89.4  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0049  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 291 aa  89.4  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  35.43 
 
 		 349 aa  89.4  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  31.07 
 
 		 322 aa  88.6  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  30.92 
 
 		 372 aa  89  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  31.09 
 
 		 347 aa  89  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  31.55 
 
 		 357 aa  88.6  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  32.18 
 
 		 367 aa  88.6  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  32.18 
 
 		 367 aa  88.6  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  31.88 
 
 		 356 aa  88.2  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  32.46 
 
 		 369 aa  88.2  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0279  peptide chain release factor 1  31.86 
 
 		 347 aa  88.2  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.156801  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  35.63 
 
 		 365 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  31.74 
 
 		 321 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  30.92 
 
 		 357 aa  87.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 459 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  35.63 
 
 		 310 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1151  peptide chain release factor 2  32.79 
 
 		 381 aa  86.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  33.01 
 
 		 330 aa  86.7  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  34.25 
 
 		 325 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4596  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 372 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  33.33 
 
 		 378 aa  86.3  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1847  peptide chain release factor 2  30.34 
 
 		 300 aa  85.9  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0075  peptide chain release factor 2  29.95 
 
 		 282 aa  85.9  4e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00578068  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  32.68 
 
 		 373 aa  85.9  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  30.66 
 
 		 349 aa  85.5  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  32.2 
 
 		 367 aa  85.5  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  31.75 
 
 		 310 aa  85.5  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4227  peptide chain release factor 2  33.91 
 
 		 304 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358427  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  30.14 
 
 		 349 aa  85.1  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  31.9 
 
 		 365 aa  85.5  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4122  peptide chain release factor 2  33.91 
 
 		 304 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  33.91 
 
 		 332 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  30.14 
 
 		 365 aa  85.1  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>