164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2679 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2679  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
231 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1747  protein of unknown function DUF162  78.35 
 
 
231 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  73.91 
 
 
235 aa  353  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  67.1 
 
 
231 aa  319  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  67.1 
 
 
231 aa  319  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  67.1 
 
 
231 aa  319  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  67.1 
 
 
231 aa  319  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2770  protein of unknown function DUF162  68.83 
 
 
231 aa  318  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0361  hypothetical protein  67.53 
 
 
231 aa  302  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0323  hypothetical protein  67.53 
 
 
231 aa  302  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0257  hypothetical protein  67.53 
 
 
231 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0361  hypothetical protein  67.1 
 
 
231 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0340  hypothetical protein  67.1 
 
 
231 aa  299  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  55.12 
 
 
205 aa  234  6e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  34.76 
 
 
236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  34.33 
 
 
236 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  34.33 
 
 
236 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  34.33 
 
 
236 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  34.33 
 
 
236 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  35.37 
 
 
241 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  34.76 
 
 
236 aa  158  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  35.19 
 
 
236 aa  158  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  36.02 
 
 
236 aa  158  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  33.48 
 
 
236 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  33.05 
 
 
236 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  33.05 
 
 
236 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  38.82 
 
 
240 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  32.03 
 
 
230 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  32.34 
 
 
230 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  32.34 
 
 
230 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  31.91 
 
 
230 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  38.33 
 
 
244 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1898  hypothetical protein  28.57 
 
 
227 aa  90.9  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  35.14 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  27.92 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  41.82 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  31.82 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  26.57 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  31.82 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  31.82 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  36.11 
 
 
227 aa  64.3  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  34.65 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  25.4 
 
 
216 aa  63.5  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  31.45 
 
 
228 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  32.17 
 
 
226 aa  63.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  32.35 
 
 
243 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  34.51 
 
 
219 aa  62.4  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  29.05 
 
 
216 aa  61.6  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  34.23 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  34.13 
 
 
210 aa  59.7  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  37.89 
 
 
219 aa  59.3  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  34.15 
 
 
197 aa  58.9  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  27.46 
 
 
220 aa  58.9  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  25.86 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  34.65 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  34.65 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  30.27 
 
 
218 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  25 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  33.96 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  33.01 
 
 
224 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  39.58 
 
 
194 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  31.96 
 
 
142 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  31.37 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  30.69 
 
 
213 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  31.58 
 
 
223 aa  55.1  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  32.11 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  36.08 
 
 
189 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  31.67 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  31.11 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  25.11 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  29.23 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  29.81 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  30.84 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  30.84 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0889  protein of unknown function DUF162  37.78 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  34.45 
 
 
209 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  34.31 
 
 
185 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  30.84 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  30.84 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  30.84 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  30.84 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  33.01 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  28.3 
 
 
229 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  31.68 
 
 
209 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  38.26 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  33.01 
 
 
225 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  30.84 
 
 
254 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  32.08 
 
 
187 aa  52.4  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  30 
 
 
220 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
212 aa  52.4  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  38.2 
 
 
218 aa  52  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  30.39 
 
 
214 aa  52.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  32 
 
 
221 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
212 aa  51.6  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  28.09 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  30 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  29.67 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  24.46 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>