62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0131 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6231  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  41.93 
 
 		 1275 aa  944    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0131  hypothetical protein  100 
 
 		 1249 aa  2572    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3309  molybdate metabolism regulator  29.62 
 
 		 1139 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3293  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1139 aa  164  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1981  molybdate metabolism regulator  29.67 
 
 		 1137 aa  163  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3301  molybdate metabolism regulator  26.07 
 
 		 1139 aa  159  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2998  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1139 aa  157  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.379625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0389  WGR domain-containing protein  29.88 
 
 		 1127 aa  152  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489109  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1490  molybdate metabolism regulator  30.4 
 
 		 1146 aa  141  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1890  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1104 aa  140  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2405  molybdate metabolism regulator  27.76 
 
 		 1264 aa  138  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0928  molybdate metabolism regulator MolR  27.76 
 
 		 1262 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3099  hypothetical protein  30.68 
 
 		 963 aa  135  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1559  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1422 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00113034  normal  0.54885 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1532  WGR domain-containing protein  28.06 
 
 		 1264 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2883  WGR domain-containing protein  25.97 
 
 		 1216 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.282061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2966  hypothetical protein  31.37 
 
 		 1083 aa  131  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00498883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2250  molybdate metabolism regulator  27.76 
 
 		 1264 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02045  molybdate metabolism regulator  26.87 
 
 		 1264 aa  129  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  29.13 
 
 		 1314 aa  129  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0596  WGR domain-containing protein  26.42 
 
 		 1130 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1888  WGR domain-containing protein  30.99 
 
 		 1099 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.735495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4404  hypothetical protein  31.86 
 
 		 1012 aa  121  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2909  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1116 aa  120  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.011304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1670  hypothetical protein  29.13 
 
 		 988 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.596851  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02046  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1210 aa  117  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02004  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1210 aa  117  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0598  WGR domain-containing protein  28.62 
 
 		 1125 aa  116  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3102  molybdate metabolism regulator MolR homolog  27.54 
 
 		 1209 aa  113  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.772316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2251  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  27.66 
 
 		 1210 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1531  putative regulator  27.66 
 
 		 1210 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1541  putative regulator  27.23 
 
 		 1210 aa  110  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0927  molybdate metabolism regulator MolR-like protein  25.83 
 
 		 1220 aa  110  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1889  WGR domain-containing protein  30.3 
 
 		 1086 aa  105  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00599399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4265  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1178 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1496  hypothetical protein  23.43 
 
 		 465 aa  102  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00864727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1013  hypothetical protein  24.61 
 
 		 1108 aa  102  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7546  dihydrolipoamide acetyltransferase  26.32 
 
 		 1329 aa  102  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0597  WGR domain-containing protein  27.03 
 
 		 1086 aa  99  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1395  WGR domain-containing protein  29.41 
 
 		 1291 aa  98.6  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4309  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1055 aa  94  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0234  molybdate metabolism regulator  25.85 
 
 		 1094 aa  90.9  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4413  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1001 aa  86.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  21.56 
 
 		 754 aa  85.1  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1394  WGR domain-containing protein  27.43 
 
 		 1297 aa  79.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753889  normal  0.407272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3551  hypothetical protein  21.86 
 
 		 670 aa  75.1  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0236032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4075  hypothetical protein  22.02 
 
 		 634 aa  75.1  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  22.5 
 
 		 762 aa  75.1  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1935  hypothetical protein  23.61 
 
 		 837 aa  71.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.273514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2623  hypothetical protein  27.61 
 
 		 903 aa  70.5  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.830052  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  23.83 
 
 		 857 aa  67  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  22.04 
 
 		 898 aa  66.2  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7811  hypothetical protein  23.26 
 
 		 817 aa  65.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  20.48 
 
 		 789 aa  63.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1930  hypothetical protein  24.72 
 
 		 852 aa  62.4  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7144  hypothetical protein  21.25 
 
 		 811 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  20.43 
 
 		 800 aa  53.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  21.62 
 
 		 862 aa  50.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  21.89 
 
 		 862 aa  50.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1886  hypothetical protein  26.22 
 
 		 838 aa  47  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292841  normal  0.495378 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3467  regulatory protein, LuxR  20 
 
 		 739 aa  46.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0929812 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  19.76 
 
 		 774 aa  45.8  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>