74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5092 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_5092  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 139 aa  288  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  48.48 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1329  thioesterase superfamily protein  46.88 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2232  thioesterase superfamily protein  45.08 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2197  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021618  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4467  thioesterase superfamily protein  37.41 
 
 		 150 aa  104  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2179  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2690  thioesterase superfamily protein  40.44 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.58 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1512  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  35.11 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0657  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7163  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0500589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0277  putative 4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  30.43 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0588  thioesterase superfamily protein  31.69 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3950  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  30.83 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0822744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3837  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  30.83 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.488766 
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  30.47 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4073  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3622  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.22745 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1827  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  32.82 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1590  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.228465  hitchhiker  0.00903187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3576  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1990  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0483278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7090  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.41 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6462  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1888  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14220  4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  31.93 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2312  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.12 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.12 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.78 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0170  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.38 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  25.38 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.84 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.39 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2461  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  29.69 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  25.74 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3115  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  28.06 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4370  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.327633  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0270  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1251  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.757255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  25.18 
 
 		 154 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2765  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0173691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2843  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0401638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2941  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4902  thioesterase-like  23.7 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.39 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0310  thioesterase superfamily protein  29.35 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.121979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1240  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.17 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2489  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 		 139 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.74 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2063  thioesterase-like  27.34 
 
 		 314 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.529459 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1353  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.3 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.72 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1486  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  26.19 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.42 
 
 		 134 aa  40  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 		 140 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.78 
 
 		 159 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.48 
 
 		 159 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>