More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4103 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 140 aa  278  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  75 
 
 		 136 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  75 
 
 		 131 aa  177  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  75 
 
 		 131 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  73.28 
 
 		 198 aa  170  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  70.18 
 
 		 221 aa  167  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  69.83 
 
 		 258 aa  164  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  59.8 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  58.82 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  58.82 
 
 		 188 aa  125  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 105 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 104 aa  117  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  55.66 
 
 		 157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  51.89 
 
 		 223 aa  110  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  55.56 
 
 		 104 aa  103  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  52.04 
 
 		 98 aa  103  8e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 171 aa  102  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  50.51 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  50 
 
 		 100 aa  98.6  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  49.49 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 104 aa  96.7  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 104 aa  96.7  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  50.53 
 
 		 131 aa  92  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  91.3  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  49.49 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 115 aa  90.9  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  48.51 
 
 		 101 aa  90.5  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  47.47 
 
 		 103 aa  90.1  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 115 aa  90.1  9e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  45.45 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  49.49 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  47.06 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  48.48 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0589  50S ribosomal protein L21  48.33 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  47.42 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  49.15 
 
 		 230 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 		 102 aa  87.8  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  48.04 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  47.06 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  44.9 
 
 		 102 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0439  50S ribosomal protein L21  45.38 
 
 		 146 aa  87.4  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 102 aa  87.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4922  50S ribosomal protein L21  47.37 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179671  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0246  50S ribosomal protein L21  49.17 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  47.47 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  47.96 
 
 		 149 aa  87  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  42.86 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 104 aa  87.4  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0151  50S ribosomal protein L21  47.5 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.772781  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4414  50S ribosomal protein L21  48.25 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  47.47 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  43.88 
 
 		 102 aa  86.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4877  50S ribosomal protein L21  48.25 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1119  50S ribosomal protein L21  46.3 
 
 		 105 aa  86.7  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  44.9 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  49 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  46.46 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  46.46 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>