63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0878 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  100 
 
 		 252 aa  495  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  48.43 
 
 		 247 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  48.43 
 
 		 247 aa  191  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  46.46 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  42.06 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  40.87 
 
 		 249 aa  175  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  42.23 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  33.47 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  36.55 
 
 		 251 aa  135  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  32 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  31.2 
 
 		 258 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  32.94 
 
 		 262 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  31.87 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  34.24 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  32.26 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  32.13 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  31.13 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  33.99 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  33.98 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  32.28 
 
 		 275 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  30.8 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  33.85 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  29.44 
 
 		 587 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  34.12 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  27.97 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  27.59 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  30.89 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  29 
 
 		 288 aa  89.7  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  31.15 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  31.27 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  29.07 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  26.28 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4182  MOSC domain containing protein  28.47 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  26.97 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  29.67 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  28.86 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  28.45 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  26.69 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  28.63 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  32.17 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  21.99 
 
 		 366 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  32.76 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4642  MOSC domain protein beta barrel domain protein  27.05 
 
 		 311 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.329604  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  33.03 
 
 		 267 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  26.43 
 
 		 267 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  26.5 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  25.26 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  30.7 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3776  MOSC domain-containing protein  34.31 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  22.81 
 
 		 616 aa  46.2  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2669  MOSC  27.13 
 
 		 266 aa  45.4  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7473  hypothetical protein  33.66 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427254 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  26.36 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  26.85 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  31.86 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  33.94 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0141  MOSC domain containing protein  30.99 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  33.33 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1825  MOSC domain containing protein  30.56 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4133  MOSC domain containing protein  32.89 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1762  uncharacterized Fe-S protein  26.6 
 
 		 288 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0270  MOSC domain-containing protein  34.45 
 
 		 290 aa  42.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3078  MOSC domain containing protein  31.94 
 
 		 287 aa  42  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.558728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>