52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0144 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 102 aa  205  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  63.92 
 
 		 98 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  45.05 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  36.17 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  40.62 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.05 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  38.95 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  34.74 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  38.46 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  39.58 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.71 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  40.86 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  37.5 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  33.68 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.65 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  41.57 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.63 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  36.84 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.17 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.05 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  35.29 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  34.41 
 
 		 94 aa  52  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  37.63 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  35.06 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  34.04 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  29.47 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  38.14 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.63 
 
 		 95 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  35.05 
 
 		 101 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  35.11 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  35.48 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  29.9 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  40.22 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  42.86 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.79 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  27.84 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  34.41 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  32.26 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  43.75 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.26 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.26 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  35.48 
 
 		 92 aa  42.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.26 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  32.26 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  28.87 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  34.41 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  31.91 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  33.33 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.26 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  29.47 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>