48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2841 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  100 
 
 		 693 aa  1445    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3179  protein tyrosine/serine phosphatase  42.13 
 
 		 192 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  39.64 
 
 		 194 aa  146  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  38.31 
 
 		 182 aa  127  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  39.29 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2473  protein tyrosine/serine phosphatase  36.48 
 
 		 226 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.668648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13660  hypothetical protein  36.36 
 
 		 218 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.615476  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0208  protein tyrosine/serine phosphatase  32.65 
 
 		 189 aa  96.7  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1223  hypothetical protein  36.84 
 
 		 218 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  30.65 
 
 		 202 aa  95.1  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0084  hypothetical protein  29.19 
 
 		 498 aa  90.9  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00246514  hitchhiker  0.000370561 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3370  hypothetical protein  31.15 
 
 		 488 aa  88.6  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1093  hypothetical protein  28.92 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000429032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0048  protein tyrosine/serine phosphatase  30.14 
 
 		 204 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1524  protein tyrosine/serine phosphatase  34.44 
 
 		 182 aa  79.3  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1148  protein of unknown function DUF442  37.72 
 
 		 164 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000013727  hitchhiker  0.0000203259 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1518  protein tyrosine/serine phosphatase  31.45 
 
 		 220 aa  62.4  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27373  predicted protein  32.59 
 
 		 363 aa  60.1  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2257  protein tyrosine/serine phosphatase  32.08 
 
 		 244 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0803  dual specificity protein phosphatase  30.51 
 
 		 182 aa  54.7  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.265228  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2352  protein tyrosine/serine phosphatase  27.22 
 
 		 241 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297898  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0236  hypothetical protein  31.2 
 
 		 226 aa  54.3  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2078  hypothetical protein  27.22 
 
 		 241 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0412  protein tyrosine/serine phosphatase  31.2 
 
 		 226 aa  54.3  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270041  hitchhiker  0.00092247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2038  protein tyrosine/serine phosphatase  27.22 
 
 		 241 aa  54.3  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  33.96 
 
 		 244 aa  53.9  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46361  protein tyrosine/serine phosphatase  31.37 
 
 		 212 aa  52.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3253  protein tyrosine/serine phosphatase  30.08 
 
 		 223 aa  53.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2901  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 		 241 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352749  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1017  protein tyrosine/serine phosphatase  31.03 
 
 		 229 aa  52.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04426  tyrosine phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07000)  27.13 
 
 		 232 aa  51.6  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.197924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2662  protein tyrosine/serine phosphatase  27.48 
 
 		 241 aa  50.8  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.037734  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0375  tyrosine/serine protein phosphatase  28.46 
 
 		 191 aa  50.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1184  hypothetical protein  26.83 
 
 		 165 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.631601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  28.08 
 
 		 241 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2105  protein tyrosine/serine phosphatase  30.65 
 
 		 220 aa  49.7  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0444  hypothetical protein  38.18 
 
 		 242 aa  47.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.149194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4280  hypothetical protein  24.71 
 
 		 276 aa  47.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00356586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4537  protein tyrosine/serine phosphatase  27.2 
 
 		 221 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0043  protein tyrosine/serine phosphatase  29.38 
 
 		 197 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3507  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3576  hypothetical protein  22.22 
 
 		 193 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4158  hypothetical protein  29.87 
 
 		 157 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.542699 
 
 
-
 
NC_006686  CND03710  protein-tyrosine-phosphatase, putative  25.93 
 
 		 212 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0986635  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  25.6 
 
 		 166 aa  46.2  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58142  putative tyrosine phosphatase  23.08 
 
 		 172 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.973876  normal  0.993909 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  24.19 
 
 		 241 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0813  hypothetical protein  26.23 
 
 		 165 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03075  putative tyrosine specific protein phosphatase  53.12 
 
 		 214 aa  44.3  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>