169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2301 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2301  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 		 336 aa  690    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1505  phosphatidylserine decarboxylase-related  63.33 
 
 		 338 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1483  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  63.25 
 
 		 332 aa  425  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.307575 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0603  phosphatidylserine decarboxylase-related  60.91 
 
 		 329 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1862  phosphatidylserine decarboxylase-related  58.72 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2685  phosphatidylserine decarboxylase-related  56.23 
 
 		 329 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2692  phosphatidylserine decarboxylase-related  56.84 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  33.2 
 
 		 1264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  27.12 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03188  phosphatidylserine decarboxylase Psd2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13970)  31.23 
 
 		 1053 aa  99.8  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.927453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1976  phosphatidylserine decarboxylase  26.75 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129589 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  30.27 
 
 		 1064 aa  97.1  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  27.2 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  26.78 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  26.23 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  27.12 
 
 		 306 aa  87.8  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0033  phosphatidylserine decarboxylase  24.19 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.484885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  25.83 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  24.9 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1652  phosphatidylserine decarboxylase-related  26.67 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.178004 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1961  phosphatidylserine decarboxylase-related  29.61 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.23874  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04930  conserved hypothetical protein  25.31 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2446  phosphatidylserine decarboxylase  29.8 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779952  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  24.61 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07989  phosphatidylserine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16930)  25.94 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2462  phosphatidylserine decarboxylase  25.88 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0788063  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  27.98 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2358  phosphatidylserine decarboxylase  29.02 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  27.98 
 
 		 610 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  28.76 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0587  phosphatidylserine decarboxylase  26.36 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.31062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  26.64 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  23.85 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  27.74 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  26.85 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  27.52 
 
 		 613 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  27.75 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  27.5 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  27.27 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  24.9 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1509  phosphatidylserine decarboxylase  29.02 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.121972  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  24.37 
 
 		 286 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  25.21 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  27.27 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  26.64 
 
 		 289 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  27.27 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  30.46 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3064  phosphatidylserine decarboxylase  27.48 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  25.62 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  26.03 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3539  phosphatidylserine decarboxylase  22.82 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  27.2 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  26.38 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  23.46 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  26.67 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  26.14 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  26.14 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01257  phosphatidylserine decarboxylase  31.64 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  27.23 
 
 		 283 aa  67  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2314  phosphatidylserine decarboxylase  26.12 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0294543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4583  phosphatidylserine decarboxylase  27.66 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943742  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4381  phosphatidylserine decarboxylase  23.23 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706772  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  25.2 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  25.2 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  25.2 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0681  phosphatidylserine decarboxylase  27.75 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  23.14 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  23.14 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  23.14 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  26 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  23.14 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4251  phosphatidylserine decarboxylase  25 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0989  phosphatidylserine decarboxylase  23.35 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  24.59 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  21.92 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0634  phosphatidylserine decarboxylase  26.73 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697003  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  24.59 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2859  phosphatidylserine decarboxylase  28.44 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  25.23 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0573  phosphatidylserine decarboxylase  25.42 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.864728  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04030  phosphatidylserine decarboxylase  24.18 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0258247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4419  phosphatidylserine decarboxylase  24.32 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4631  phosphatidylserine decarboxylase  24.18 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  24.18 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  23.11 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4692  phosphatidylserine decarboxylase  24.18 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  24.18 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  23.66 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  24.18 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  24.18 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  24.18 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265826  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  24.86 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  24.86 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  24.86 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4189  phosphatidylserine decarboxylase  24.77 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0422  phosphatidylserine decarboxylase  22.99 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161477  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4235  phosphatidylserine decarboxylase  24.32 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  24.32 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4565  phosphatidylserine decarboxylase  24.32 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>