More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1973 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  100 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  41.45 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  40.34 
 
 
292 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  39.35 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  40.55 
 
 
266 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3527  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 
307 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.237024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  39.19 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  28.48 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  43.48 
 
 
179 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  31.13 
 
 
285 aa  126  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  31.36 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5728  OmpA/MotB domain protein  32.47 
 
 
294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  42.86 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  28.35 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1593  OmpA/MotB domain protein  28.28 
 
 
290 aa  114  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.907299  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  44.53 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  27.24 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3481  OmpA/MotB domain protein  28 
 
 
282 aa  112  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  41.38 
 
 
267 aa  112  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  37.02 
 
 
261 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.36 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  47.9 
 
 
257 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  48.36 
 
 
266 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  37.36 
 
 
262 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  37.36 
 
 
262 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 
305 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  46.28 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  40.91 
 
 
262 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  43.88 
 
 
271 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  40.91 
 
 
262 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  40.91 
 
 
262 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  40.71 
 
 
254 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
253 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4407  chemotaxis protein motB, C-terminus  40.91 
 
 
156 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  40.52 
 
 
273 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0831  OmpA/MotB domain-containing protein  28.48 
 
 
314 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.322779  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  36.09 
 
 
338 aa  105  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  38.71 
 
 
275 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  41.06 
 
 
273 aa  105  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  35 
 
 
261 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  35 
 
 
261 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  46.09 
 
 
290 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  46.28 
 
 
251 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  38.41 
 
 
249 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  42.4 
 
 
258 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  36.31 
 
 
261 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
245 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  40.83 
 
 
271 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  45 
 
 
266 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  42.97 
 
 
272 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  41.01 
 
 
259 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  32.69 
 
 
266 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  41.61 
 
 
525 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2377  OmpA/MotB domain protein  33.71 
 
 
295 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447675  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  41.61 
 
 
525 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  45.74 
 
 
323 aa  102  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3661  flagellar motor protein MotD  37.66 
 
 
285 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  31.73 
 
 
263 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  40.67 
 
 
271 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  42.97 
 
 
275 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  44.53 
 
 
252 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  42.24 
 
 
648 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
236 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  37.09 
 
 
285 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  35.57 
 
 
275 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  33.96 
 
 
463 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  37.09 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  33.95 
 
 
257 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  37.09 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  31.16 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  37.43 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1375  putative flagellar motor protein (MotB)  40.62 
 
 
230 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0852  OmpA/MotB domain-containing protein  42.15 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.755762  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  35.57 
 
 
238 aa  97.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  38.78 
 
 
305 aa  96.3  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  35.23 
 
 
343 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  39.84 
 
 
281 aa  95.5  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  40.34 
 
 
343 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  40.14 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  39.5 
 
 
242 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1569  flagellar motor protein MotD  37.16 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474661  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  33.89 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  38.41 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  36 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45540  flagellar motor protein MotD  37.66 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.811182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  45.38 
 
 
623 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  31.42 
 
 
375 aa  93.6  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  40.83 
 
 
799 aa  94  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  38.69 
 
 
525 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2921  OmpA/MotB domain-containing protein  26.51 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  36.07 
 
 
251 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  38.41 
 
 
309 aa  92.4  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  29.62 
 
 
343 aa  92.4  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  42.02 
 
 
343 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4998  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  36.09 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  31.76 
 
 
269 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  36.36 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1523  OmpA/MotB  36.65 
 
 
248 aa  90.1  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  40.83 
 
 
784 aa  90.1  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>