86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1100 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1100  putative RNA methylase  100 
 
 		 329 aa  670    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  76.29 
 
 		 334 aa  536  1e-151  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  75.68 
 
 		 333 aa  528  1e-149  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  75.68 
 
 		 330 aa  495  1e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  29.77 
 
 		 336 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0151  putative RNA methylase  27.22 
 
 		 356 aa  89.7  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  28.08 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1371  putative RNA methylase  28.5 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  27.75 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  28.7 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  30.13 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  25.13 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  25.23 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  27.05 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  26.59 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  26.18 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  25.22 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_002950  PG1362  hypothetical protein  22.95 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0287  putative RNA methylase  22.19 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  28.63 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  23.16 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  24.06 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  24.77 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  22.05 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  25.52 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  25.81 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  21.17 
 
 		 364 aa  53.9  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  25.32 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  26.03 
 
 		 343 aa  53.5  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  26.62 
 
 		 365 aa  53.5  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  22.99 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  25.93 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0282  hypothetical protein  22.46 
 
 		 388 aa  51.2  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.439028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  23.85 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  33.11 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  22.92 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  22.92 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  22.92 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  22.92 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  22.92 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  22.92 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  26.04 
 
 		 371 aa  49.7  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  22.57 
 
 		 379 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  22.57 
 
 		 379 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 360 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  22.15 
 
 		 379 aa  49.3  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  24.79 
 
 		 375 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  22.57 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  22.61 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  24.79 
 
 		 375 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  24.6 
 
 		 374 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  31.47 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  25.07 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  24.87 
 
 		 375 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  23.53 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1420  putative RNA methylase  21.8 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00712049  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  23.85 
 
 		 379 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2614  methyltransferase small  33.04 
 
 		 202 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  28.36 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0553  methyltransferase small  27.52 
 
 		 196 aa  47.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0322683  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  22.39 
 
 		 706 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  22.39 
 
 		 706 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  22.39 
 
 		 706 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  22.61 
 
 		 376 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  28.74 
 
 		 374 aa  46.2  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0303  hypothetical protein  23.6 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00482447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5876  putative RNA methylase  34.48 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0137254  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  21.16 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  21.76 
 
 		 706 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  21.88 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  29.75 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0259  putative RNA methylase  29.87 
 
 		 480 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15560  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  27.27 
 
 		 339 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0028  hypothetical protein  23.68 
 
 		 400 aa  44.3  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138235  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  28.67 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  30.38 
 
 		 393 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1763  putative RNA methylase  26.91 
 
 		 371 aa  43.5  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  50 
 
 		 474 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08561  putative N6-adenine-specific DNA methylase  20.75 
 
 		 381 aa  43.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  22.69 
 
 		 705 aa  43.1  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1460  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  23.31 
 
 		 702 aa  43.1  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.372421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0925  putative RNA methylase  20.97 
 
 		 398 aa  43.1  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1927  23S rRNA methyltransferase/RumA  31.73 
 
 		 419 aa  43.1  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317953  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  40 
 
 		 484 aa  42.7  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3084  putative RNA methylase  23.22 
 
 		 378 aa  42.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0569  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  29.7 
 
 		 408 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>