More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0023 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 		 135 aa  263  5e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  74.64 
 
 		 138 aa  203  6e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  70.8 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  72.8 
 
 		 145 aa  191  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  41.07 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  42.72 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  40.74 
 
 		 116 aa  83.6  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  43 
 
 		 236 aa  80.5  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  35 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  38 
 
 		 195 aa  77.4  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  40.62 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  37.23 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  38 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.63 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  33.94 
 
 		 247 aa  67  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  30.36 
 
 		 265 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  29.82 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  29.82 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  37.61 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  35.42 
 
 		 245 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1450  molybdenum-binding protein  32.74 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1779  LysR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 95 aa  62  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 270 aa  60.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0230  putative transcriptional regulator, ModE family  34.58 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 262 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  28.3 
 
 		 262 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 269 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  34.86 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  30.19 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  32.99 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  35.78 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  38.37 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  32.73 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  28.7 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  31 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  29.91 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  34.04 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  29.07 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  30.39 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  32.63 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0339  molybdate metabolism transcriptional regulator  49.15 
 
 		 358 aa  55.1  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  32.18 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  30.23 
 
 		 263 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 258 aa  53.9  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  30.43 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  31.03 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 263 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  29.36 
 
 		 268 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2092  hypothetical protein  31.03 
 
 		 366 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  32.67 
 
 		 270 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 263 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  32.11 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1577  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  36.84 
 
 		 369 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  28.7 
 
 		 257 aa  51.6  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3020  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  30.51 
 
 		 359 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475131  normal  0.0124041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0967  molybdate metabolism transcriptional regulator  32.04 
 
 		 359 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 278 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0119  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 334 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3123  ModE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 279 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  28.04 
 
 		 245 aa  51.2  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  34.29 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  28.04 
 
 		 233 aa  51.2  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2030  ModE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 299 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  27.59 
 
 		 263 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 268 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  36.51 
 
 		 263 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>