189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3123 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3123  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 		 279 aa  547  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2469  putative transcriptional regulator, ModE family  78.49 
 
 		 261 aa  319  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317558  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2030  ModE family transcriptional regulator  60 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4545  ModE family transcriptional regulator  60.82 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2857  ModE family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 255 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1521  ModE family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 278 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  36.61 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  40.85 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 254 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  34.98 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  47.59 
 
 		 252 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  47.59 
 
 		 252 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  33.19 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  39.44 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  39.44 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 290 aa  92.4  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  39.81 
 
 		 263 aa  92.4  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1175  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.6 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 254 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 254 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 268 aa  89  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 254 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.79 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  36.04 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  39.2 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  39.2 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  35.21 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  35.16 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  31.2 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  29.58 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.02 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  30.81 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2884  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.5 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  31.56 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  34.48 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  29.71 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  32.45 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  37.61 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.87 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.63 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2939  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.99 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  32.77 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2852  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.99 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  35.62 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  35.62 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  30.73 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  35.62 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  35.62 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  35.62 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  35.62 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  31.36 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  35.62 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  32.39 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  34.7 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 278 aa  72  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0906  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.27 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0682  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.27 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2881  transcriptional regulator, ModE family  35.64 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000144972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0784  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.64 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0788  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.64 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0864  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.64 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0815  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.64 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2901  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.64 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.052498  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  32.57 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0843  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.42 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0874  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.42 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0815  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.42 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0929  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.42 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.177252 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0824  transcriptional regulator, ModE family  31.05 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.027921  hitchhiker  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  31.76 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  28.3 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  29.77 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0831  ModE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000109741  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  34.12 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3537  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000170049  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>