171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2030 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2030  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  563  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3123  ModE family transcriptional regulator  60.36 
 
 		 279 aa  241  9e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2469  putative transcriptional regulator, ModE family  57.3 
 
 		 261 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317558  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1521  ModE family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2857  ModE family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 255 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4545  ModE family transcriptional regulator  57.64 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 276 aa  96.7  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 254 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 254 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  36.23 
 
 		 252 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 254 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  35.85 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 254 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  35.15 
 
 		 270 aa  90.1  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.19 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2939  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.19 
 
 		 263 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 270 aa  89.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2852  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.19 
 
 		 263 aa  89.4  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1175  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.18 
 
 		 263 aa  89  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  36.91 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 268 aa  86.3  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.33 
 
 		 263 aa  85.9  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  36.32 
 
 		 272 aa  85.5  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2884  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.47 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.76 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.67 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  31.89 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  28.39 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2881  transcriptional regulator, ModE family  32.09 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000144972  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0815  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.18 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2901  DNA-binding transcriptional regulator ModE  32.09 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.052498  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0843  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.18 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0874  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.18 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0929  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.18 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.177252 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0864  DNA-binding transcriptional regulator ModE  32.09 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0682  DNA-binding transcriptional regulator ModE  32.09 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0815  DNA-binding transcriptional regulator ModE  32.09 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0788  DNA-binding transcriptional regulator ModE  32.09 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0784  DNA-binding transcriptional regulator ModE  31.69 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  35.58 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  35.58 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  36.08 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0906  DNA-binding transcriptional regulator ModE  32.73 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0770  ModE family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  28.65 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  30.47 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3194  ModE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.112161  hitchhiker  0.0000253797 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  27.88 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0824  transcriptional regulator, ModE family  30.22 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.027921  hitchhiker  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  36.61 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  30.28 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  38.83 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  31.62 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0744  ModE family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139669 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3862  molybdenum transport regulatory protein ModE  32.08 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  30.27 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3537  ModE family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000170049  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  33.58 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  38.59 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  38.59 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  30.69 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0831  ModE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000109741  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  33.46 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  29.47 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  32.9 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  42.86 
 
 		 123 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  27.87 
 
 		 260 aa  67  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  42.86 
 
 		 123 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  28.19 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  28.92 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  30.83 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  30.45 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  33.08 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  33.08 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  33.08 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  33.08 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  24.81 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  33.08 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  33.08 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>