245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3862 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3862  molybdenum transport regulatory protein ModE  100 
 
 		 259 aa  529  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0744  ModE family transcriptional regulator  93.82 
 
 		 259 aa  477  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139669 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0770  ModE family transcriptional regulator  92.66 
 
 		 259 aa  474  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3194  ModE family transcriptional regulator  91.89 
 
 		 259 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.112161  hitchhiker  0.0000253797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  83.01 
 
 		 259 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0831  ModE family transcriptional regulator  82.63 
 
 		 259 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000109741  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0824  transcriptional regulator, ModE family  82.63 
 
 		 259 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.027921  hitchhiker  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3537  ModE family transcriptional regulator  81.85 
 
 		 259 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000170049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  42.37 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  42.75 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  41.76 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2884  DNA-binding transcriptional regulator ModE  42.01 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1175  DNA-binding transcriptional regulator ModE  41.57 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  42.51 
 
 		 263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2852  DNA-binding transcriptional regulator ModE  41.22 
 
 		 263 aa  165  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2939  DNA-binding transcriptional regulator ModE  40.84 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  40.84 
 
 		 298 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0784  DNA-binding transcriptional regulator ModE  40.23 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0843  DNA-binding transcriptional regulator ModE  41.46 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0815  DNA-binding transcriptional regulator ModE  41.46 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0874  DNA-binding transcriptional regulator ModE  41.06 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0929  DNA-binding transcriptional regulator ModE  41.06 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.177252 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2881  transcriptional regulator, ModE family  39.84 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000144972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0788  DNA-binding transcriptional regulator ModE  39.84 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0906  DNA-binding transcriptional regulator ModE  41.06 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0682  DNA-binding transcriptional regulator ModE  39.84 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2901  DNA-binding transcriptional regulator ModE  39.84 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.052498  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0864  DNA-binding transcriptional regulator ModE  39.84 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0815  DNA-binding transcriptional regulator ModE  39.84 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  44.29 
 
 		 254 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  34.1 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 276 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  39.18 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 254 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 254 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  32.57 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  41.79 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  30.74 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  45.45 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  34.12 
 
 		 267 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  32.58 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 254 aa  111  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  33.04 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  31.27 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  33.58 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  33.58 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  29.8 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  27.45 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  29.07 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  30.24 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  33.83 
 
 		 278 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  28.68 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  31.27 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  28.51 
 
 		 270 aa  99.4  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  29.96 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 279 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  30.57 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  29.41 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 278 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  31.8 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 281 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 281 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  31.03 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  27.82 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  31.03 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  31.42 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  29.89 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 263 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  29.73 
 
 		 268 aa  85.5  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  31.73 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  28.51 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  27.69 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  32.03 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2640  ModE family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0622782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  26.72 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  32.34 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>