176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4545 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4545  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 
276 aa  515  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3123  ModE family transcriptional regulator  61.57 
 
 
279 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2030  ModE family transcriptional regulator  58.68 
 
 
299 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2469  putative transcriptional regulator, ModE family  58.82 
 
 
261 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317558  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2857  ModE family transcriptional regulator  55.35 
 
 
255 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1521  ModE family transcriptional regulator  51.74 
 
 
278 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  38.54 
 
 
276 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  31.25 
 
 
272 aa  99  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  38.2 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  34.25 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  43.48 
 
 
254 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  28.69 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  41.71 
 
 
254 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  33.87 
 
 
254 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  31.97 
 
 
268 aa  89.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  41.08 
 
 
254 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  40.54 
 
 
254 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  31.2 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  38.24 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  29.23 
 
 
257 aa  88.6  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  44.15 
 
 
252 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  45.05 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  41.58 
 
 
270 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  28.52 
 
 
268 aa  87  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  41.58 
 
 
270 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  39.01 
 
 
254 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  32.45 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  31.02 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.21 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1175  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.21 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  35.15 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  35.15 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  30.58 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  37.12 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  40.64 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  40.64 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  37.66 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  32.31 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2881  transcriptional regulator, ModE family  33.21 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000144972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2901  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.21 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.052498  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0784  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.21 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0682  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.21 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0864  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.21 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108345  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0815  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.21 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0788  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.21 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  31.58 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  34.35 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  31.02 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  34.32 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.9 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.08 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2939  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.75 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2852  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.41 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  29.47 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  35.06 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.27 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  33.08 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  31.28 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  27.57 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  28.91 
 
 
269 aa  72  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  34.34 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  37.63 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0906  DNA-binding transcriptional regulator ModE  31.82 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  29.61 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  36.23 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  40.86 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  40.86 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  33.83 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  33.83 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  33.83 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  34.73 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  33.83 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  33.83 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  33.83 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  29.7 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  48.57 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0843  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.92 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  48.57 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0815  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.92 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0874  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.92 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0929  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.92 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.177252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  27.48 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2884  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.08 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  38.71 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  39.25 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  34.55 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  31.2 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  38.42 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  50 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  30.83 
 
 
263 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  28.96 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  40.28 
 
 
127 aa  63.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  39.82 
 
 
263 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  63.83 
 
 
278 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  45.31 
 
 
126 aa  62.4  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  28.63 
 
 
274 aa  62  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  47.76 
 
 
115 aa  61.6  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
129 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0770  ModE family transcriptional regulator  34.53 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>