More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4006 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4006  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 394 aa  816    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927279  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 		 406 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4266  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 		 395 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 		 361 aa  111  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 377 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 		 371 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 		 371 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 377 aa  97.1  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  27.78 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 		 385 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1311  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 452 aa  87  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0221221  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.93 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  22.78 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  22.95 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.95 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  25 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1089  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0606318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.28 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  23.3 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.66 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  22.66 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  26.22 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  22.01 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  21.36 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 763 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1763  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.656807  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  23.98 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1440  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.185476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.9 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0231  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  24.36 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  24.9 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  22.7 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  22.88 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  25.11 
 
 		 364 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  24.7 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  27.91 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  22.85 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 		 367 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  29.66 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  28.73 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  22.42 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 		 536 aa  70.5  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  24.13 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1755  glycosyl transferase group 1  22.98 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 		 828 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00458  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.27 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  27.27 
 
 		 443 aa  69.7  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.17 
 
 		 935 aa  69.7  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>