291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3217 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3217  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 483 aa  1004    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.353692  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3807  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 		 649 aa  199  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3434  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 		 753 aa  188  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4710  glycosyl transferase family protein  40.09 
 
 		 749 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.436323  normal  0.224848 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 		 1334 aa  108  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  30.86 
 
 		 2401 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 525 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  28.09 
 
 		 731 aa  93.2  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 415 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  28.27 
 
 		 810 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.41 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 430 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  28.8 
 
 		 632 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 		 1359 aa  87.4  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 		 1077 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 		 721 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 1268 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 		 679 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 		 775 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 		 1759 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 		 880 aa  85.5  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 		 732 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 		 1435 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 728 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 		 710 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 		 624 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 		 994 aa  83.6  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 		 1486 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 		 617 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 725 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 		 1152 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 		 717 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 		 691 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 		 717 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 		 635 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 725 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 		 670 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 		 958 aa  80.5  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 		 662 aa  80.5  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 		 1152 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 684 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 		 1340 aa  79.7  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 		 729 aa  79  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  33.15 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  27.55 
 
 		 1182 aa  77.4  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 		 746 aa  77.4  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.83 
 
 		 610 aa  77  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 		 691 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 		 691 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 		 683 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 		 1106 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 		 1386 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 996 aa  75.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 		 808 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  27.9 
 
 		 700 aa  74.7  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 		 1739 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 625 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 625 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 		 652 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 		 1509 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 		 684 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  28.41 
 
 		 790 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 		 742 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 		 733 aa  72.4  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0194  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  30.18 
 
 		 1030 aa  71.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.478179  normal  0.202033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  24.54 
 
 		 576 aa  71.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 988 aa  70.9  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 		 1075 aa  71.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 		 1067 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 783 aa  70.5  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  26.44 
 
 		 1644 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 		 1188 aa  70.5  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  26.44 
 
 		 1644 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 		 983 aa  70.5  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  24.15 
 
 		 785 aa  70.1  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 		 1267 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 1991 aa  70.1  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 		 742 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 		 958 aa  69.7  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  26.67 
 
 		 860 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  24.06 
 
 		 832 aa  68.9  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 		 1275 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  27.64 
 
 		 1003 aa  67.8  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 		 625 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 		 709 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  24.08 
 
 		 531 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 		 709 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 		 748 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  24.18 
 
 		 555 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 		 632 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 		 765 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1974  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 		 853 aa  67.4  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 		 551 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 551 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  23.26 
 
 		 602 aa  66.6  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  28.31 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 		 742 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  23.97 
 
 		 280 aa  66.6  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>