More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4710 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3434  glycosyl transferase family protein  56.22 
 
 		 753 aa  809    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4710  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 749 aa  1529    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.436323  normal  0.224848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3217  glycosyl transferase family protein  40.09 
 
 		 483 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.353692  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3807  glycosyl transferase family protein  35.88 
 
 		 649 aa  160  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  35.17 
 
 		 2401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 525 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 		 733 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  36.69 
 
 		 732 aa  127  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 		 703 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 		 1435 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  34.69 
 
 		 1644 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  34.69 
 
 		 1644 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  33.6 
 
 		 725 aa  117  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  34.01 
 
 		 725 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 		 1739 aa  117  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 		 717 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 717 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  33.46 
 
 		 710 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 		 1077 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 		 635 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 		 684 aa  111  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 625 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 625 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  27.78 
 
 		 731 aa  110  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 		 729 aa  109  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 		 1334 aa  109  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 742 aa  108  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  32.08 
 
 		 632 aa  108  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  30.75 
 
 		 586 aa  108  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 1359 aa  108  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  30.77 
 
 		 700 aa  107  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 		 602 aa  107  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  31.95 
 
 		 721 aa  107  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 		 670 aa  107  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 683 aa  106  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 1509 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 		 652 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 		 880 aa  104  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 		 632 aa  104  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 415 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 728 aa  103  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  23.66 
 
 		 892 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  28.41 
 
 		 794 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 		 958 aa  102  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 		 539 aa  101  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 742 aa  101  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 		 531 aa  101  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 742 aa  100  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  28.46 
 
 		 810 aa  101  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 551 aa  100  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 		 691 aa  100  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 		 653 aa  100  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 796 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 		 1152 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.15 
 
 		 427 aa  100  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 625 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 902 aa  100  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 		 1152 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 691 aa  100  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 		 691 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 551 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 775 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 		 555 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 		 746 aa  99.4  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 		 617 aa  99.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  36.9 
 
 		 1386 aa  98.6  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 		 526 aa  97.8  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 1486 aa  97.4  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 1268 aa  97.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 		 994 aa  97.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  25.48 
 
 		 2046 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 		 832 aa  95.5  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 857 aa  95.5  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 684 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 		 430 aa  95.1  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 808 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 		 1759 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 709 aa  94.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 709 aa  94.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 		 996 aa  94.4  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 		 790 aa  94.4  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 		 824 aa  94.4  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3633  glycosyl transferase, group 1  33.85 
 
 		 510 aa  94  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.015452  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 		 723 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 662 aa  93.6  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 		 1340 aa  92.8  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.57 
 
 		 1561 aa  92  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 		 294 aa  90.9  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  31.12 
 
 		 860 aa  90.9  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  24.01 
 
 		 576 aa  90.1  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.94 
 
 		 610 aa  89.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 1075 aa  89  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 		 410 aa  88.6  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  30.47 
 
 		 1837 aa  87.8  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 		 1267 aa  87.8  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 		 1162 aa  87.4  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 		 1067 aa  87.4  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  32.62 
 
 		 337 aa  87.4  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  24.54 
 
 		 765 aa  87.4  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>