More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1205 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1205  patatin  100 
 
 		 279 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01322  Patatin  58.21 
 
 		 296 aa  342  4e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0310  hypothetical protein  31.8 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.544129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0115  patatin  33.96 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0045028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1912  patatin  29.43 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3038  putative exported phospholipase, patatin-like  30.43 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000229451  unclonable  0.00000199426 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  31.33 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  31.33 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  31 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  31 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  31 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  31 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  31 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  31.67 
 
 		 321 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  31.67 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  25.08 
 
 		 339 aa  89  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  26.28 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  32.06 
 
 		 357 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  30.38 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  31.74 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  32.91 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  27.21 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  32.28 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  31.01 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  31.01 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  33.77 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  27.39 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  27.39 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  27.39 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  27.39 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  25.26 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  31.65 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  31.01 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  27.92 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  24.43 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  27.92 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  27.5 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  27.5 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  31.76 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  31.76 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  31.85 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  27.5 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  27.33 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  27.5 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  29.75 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  29.75 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  28.85 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0062  hypothetical protein  31.55 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.968802  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  30.38 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1855  patatin  31 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  30.36 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  29.75 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  31.01 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1381  hypothetical protein  24.6 
 
 		 883 aa  70.1  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  29.75 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  29.94 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0660  Patatin  26.23 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.78646 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  29.67 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  31.4 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2119  Patatin  27.27 
 
 		 265 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000166594  decreased coverage  0.00184806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  26.84 
 
 		 767 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  30.43 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  29.75 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  27.22 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  30.19 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  28.28 
 
 		 341 aa  67  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  23.45 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  30.26 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1130  patatin  24.6 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  23.45 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  27.5 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  29.75 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  28.48 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1377  hypothetical protein  23.96 
 
 		 883 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  27.88 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  23.79 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  29.57 
 
 		 777 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  25.82 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  30.19 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1726  patatin  25.33 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0620011  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  26.14 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  29.56 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  28.48 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  29.73 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2479  hypothetical protein  23.38 
 
 		 661 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  29.89 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  28.48 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  30.36 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  27.96 
 
 		 750 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  30.19 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3042  patatin  27.32 
 
 		 586 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2334  hypothetical protein  22.46 
 
 		 665 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  24.35 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  27.95 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  26.91 
 
 		 738 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  27.85 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  26.42 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  27.85 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1077  patatin  29.61 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388578  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  27.98 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>