40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0218 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  56.36 
 
 		 121 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  41.84 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  42.39 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  38.78 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  42.42 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1459  DNA polymerase beta subunit  48.11 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  38.83 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1476  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0991  DNA polymerase beta subunit  35.78 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1154  DNA polymerase beta subunit  50.88 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.855122  normal  0.0599495 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1278  DNA polymerase beta subunit  31.58 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0999  DNA polymerase beta subunit  33.02 
 
 		 114 aa  50.8  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0343888  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1433  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.855989  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1435  DNA polymerase beta subunit  36.46 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000437505  decreased coverage  0.0000020199 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  34.52 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  35.14 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1566  DNA polymerase beta subunit  37.14 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.717428  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2681  DNA polymerase beta domain protein region  30.43 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  37.66 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1760  DNA polymerase beta domain protein region  38.33 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1689  DNA polymerase beta subunit  33.98 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000949041  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  41.86 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0500  DNA polymerase beta subunit  55 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000767476  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0494  DNA polymerase beta subunit  28.43 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  32.93 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  42.31 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1268  DNA polymerase beta subunit  29.17 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.834804 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  39.19 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  35.8 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  33.71 
 
 		 110 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  33.73 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1252  DNA polymerase beta subunit  31.65 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000815362  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50322  predicted protein  36.67 
 
 		 425 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2455  DNA polymerase beta domain protein region  48.78 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.347866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0811  DNA polymerase beta domain protein region  34 
 
 		 257 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  29.76 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1397  DNA polymerase beta subunit  34.72 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  33.75 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  57.14 
 
 		 94 aa  40  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>