14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50322 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_50322  predicted protein  100 
 
 
425 aa  882    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02250  hypothetical protein  32.43 
 
 
779 aa  171  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_2530  predicted protein  34.44 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52420  topoisomerase I-related protein  33.12 
 
 
605 aa  167  4e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05694  topoisomerase family protein TRF4, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04130)  27.52 
 
 
694 aa  139  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47057  predicted protein  34.04 
 
 
1458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15837  predicted protein  28.52 
 
 
534 aa  102  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.391811 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07748  PAP/25A associated domain family (AFU_orthologue; AFUA_5G07790)  22.84 
 
 
999 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32298  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_006686  CND05850  conserved hypothetical protein  24.88 
 
 
708 aa  58.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03442  conserved hypothetical protein  22.01 
 
 
514 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.776301  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31476  predicted protein  25.37 
 
 
781 aa  53.1  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49177  predicted protein  23.53 
 
 
1336 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116329  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94724  predicted protein  22.03 
 
 
633 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127729  decreased coverage  0.000571267 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48080  predicted protein  22.63 
 
 
502 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>