12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52420 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_52420  topoisomerase I-related protein  100 
 
 		 605 aa  1234    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02250  hypothetical protein  35.8 
 
 		 779 aa  223  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_2530  predicted protein  35.31 
 
 		 347 aa  176  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05694  topoisomerase family protein TRF4, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04130)  31.85 
 
 		 694 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50322  predicted protein  33.23 
 
 		 425 aa  167  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15837  predicted protein  29.01 
 
 		 534 aa  106  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.391811 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47057  predicted protein  26.52 
 
 		 1458 aa  93.2  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07748  PAP/25A associated domain family (AFU_orthologue; AFUA_5G07790)  27.89 
 
 		 999 aa  89.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32298  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_006686  CND05850  conserved hypothetical protein  22.52 
 
 		 708 aa  65.1  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49177  predicted protein  26.99 
 
 		 1336 aa  60.1  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116329  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94724  predicted protein  27.11 
 
 		 633 aa  57.8  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127729  decreased coverage  0.000571267 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32379  predicted protein  33.8 
 
 		 1606 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.069954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>