More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0162 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0162  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 334 aa  674    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0146  adenylosuccinate synthetase  85.5 
 
 		 332 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.531372  normal  0.191753 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0128  adenylosuccinate synthetase  85.84 
 
 		 334 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1196  adenylosuccinate synthetase  83.13 
 
 		 334 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0019  adenylosuccinate synthetase  63.36 
 
 		 336 aa  438  9.999999999999999e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.617132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0015  adenylosuccinate synthetase  52.4 
 
 		 337 aa  364  1e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000196036  normal  0.0126394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1220  Adenylosuccinate synthase  52.24 
 
 		 335 aa  363  3e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1420  adenylosuccinate synthetase  52.12 
 
 		 333 aa  350  2e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0033  adenylosuccinate synthetase  46.69 
 
 		 336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0677  adenylosuccinate synthetase  46.11 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1241  adenylosuccinate synthetase  45.95 
 
 		 337 aa  289  6e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0114647  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0146  adenylosuccinate synthetase  44.74 
 
 		 337 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00393443  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0064  adenylosuccinate synthetase  43.2 
 
 		 336 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000115242  hitchhiker  0.000142172 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0743  adenylosuccinate synthetase  44.61 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00140834  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2232  adenylosuccinate synthetase  44.41 
 
 		 350 aa  275  5e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.463237  normal  0.0169384 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0004  adenylosuccinate synthetase  43.81 
 
 		 337 aa  275  8e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2319  adenylosuccinate synthetase  42.6 
 
 		 337 aa  268  8e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0005  adenylosuccinate synthetase  42.9 
 
 		 346 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1964  adenylosuccinate synthetase  43.98 
 
 		 337 aa  259  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1359  adenylosuccinate synthase  40.36 
 
 		 338 aa  239  5e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  32.02 
 
 		 444 aa  186  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0550  adenylosuccinate synthetase  31.37 
 
 		 431 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0526  adenylosuccinate synthetase  31.37 
 
 		 431 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2004  adenylosuccinate synthase  33.72 
 
 		 561 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00819563  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2857  adenylosuccinate synthetase  30.39 
 
 		 445 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2390  adenylosuccinate synthetase  31.4 
 
 		 434 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1049  adenylosuccinate synthetase  30.73 
 
 		 435 aa  169  7e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0610  Adenylosuccinate synthase  33.43 
 
 		 507 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278665  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0941  adenylosuccinate synthetase  30.5 
 
 		 435 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2132  adenylosuccinate synthetase  33.17 
 
 		 427 aa  166  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000468413  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1816  adenylosuccinate synthetase  31.33 
 
 		 434 aa  166  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0528  adenylosuccinate synthetase  30.33 
 
 		 429 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650318  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0498  Adenylosuccinate synthase  33.88 
 
 		 550 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000018536  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  30.33 
 
 		 430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  30.35 
 
 		 430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  30.42 
 
 		 430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  30.5 
 
 		 430 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  30.19 
 
 		 430 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  29.88 
 
 		 431 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0677  adenylosuccinate synthetase  29.76 
 
 		 429 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  30.09 
 
 		 430 aa  162  7e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0645  adenylosuccinate synthetase  30.71 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2196  adenylosuccinate synthetase  31.16 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2031  adenylosuccinate synthetase  28.99 
 
 		 435 aa  161  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0330  adenylosuccinate synthetase  28.95 
 
 		 428 aa  160  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  29.72 
 
 		 430 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  29.72 
 
 		 430 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  29.72 
 
 		 430 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2262  adenylosuccinate synthetase  29.47 
 
 		 429 aa  159  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0914846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  29.48 
 
 		 430 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4927  Adenylosuccinate synthase  31.52 
 
 		 427 aa  159  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089661  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0213  adenylosuccinate synthetase  30.12 
 
 		 434 aa  159  8e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.816026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1810  adenylosuccinate synthetase  29.52 
 
 		 429 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.2738  normal  0.518624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  31.29 
 
 		 432 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  29.48 
 
 		 430 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  29.04 
 
 		 430 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  29.04 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  30.73 
 
 		 431 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3013  adenylosuccinate synthetase  30.33 
 
 		 430 aa  156  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220071  normal  0.0269955 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2626  adenylosuccinate synthase  30.26 
 
 		 437 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000737689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1282  adenylosuccinate synthetase  30.28 
 
 		 431 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3260  adenylosuccinate synthetase  29.81 
 
 		 430 aa  156  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574684  hitchhiker  0.00000000000114461 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0322  adenylosuccinate synthetase  30.43 
 
 		 434 aa  155  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2126  adenylosuccinate synthetase  30.02 
 
 		 428 aa  155  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  28.37 
 
 		 432 aa  155  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2209  adenylosuccinate synthase  30.64 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000023884  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  29.62 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  29.74 
 
 		 431 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  30.42 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0540  adenylosuccinate synthetase  30.19 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.311763  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0552  adenylosuccinate synthetase  28.4 
 
 		 432 aa  153  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000130749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  28.74 
 
 		 433 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2149  adenylosuccinate synthetase  28.44 
 
 		 425 aa  152  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.755328  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3019  adenylosuccinate synthetase  27.86 
 
 		 424 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2764  adenylosuccinate synthase  28.57 
 
 		 431 aa  152  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0565  adenylosuccinate synthetase  28.17 
 
 		 432 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22549e-25 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1452  adenylosuccinate synthetase  28.64 
 
 		 433 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.719728  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1328  adenylosuccinate synthetase  29.98 
 
 		 432 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1720  adenylosuccinate synthetase  31.67 
 
 		 397 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5638  adenylosuccinate synthetase  29.43 
 
 		 424 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0744769  normal  0.421988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  29.71 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1647  adenylosuccinate synthetase  31.42 
 
 		 397 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  30.55 
 
 		 432 aa  150  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0403  adenylosuccinate synthetase  28.81 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.841501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  27.93 
 
 		 431 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  30.05 
 
 		 431 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1370  adenylosuccinate synthetase  27.18 
 
 		 416 aa  149  5e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3648  adenylosuccinate synthetase  29.72 
 
 		 432 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0694  adenylosuccinate synthetase  29.72 
 
 		 432 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3793  adenylosuccinate synthetase  29.72 
 
 		 432 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4763  adenylosuccinate synthetase  30.59 
 
 		 432 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.707154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4634  adenylosuccinate synthetase  30.59 
 
 		 432 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  28.07 
 
 		 430 aa  149  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  30.53 
 
 		 431 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4727  adenylosuccinate synthetase  31.54 
 
 		 432 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4644  adenylosuccinate synthetase  31.54 
 
 		 432 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4784  adenylosuccinate synthetase  31.54 
 
 		 432 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  30.77 
 
 		 431 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0119  adenylosuccinate synthetase  28.06 
 
 		 423 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4420  adenylosuccinate synthetase  31.54 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>