More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0292 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0292  elongation factor P  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal  0.0255427 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0323  elongation factor P  87.23 
 
 		 233 aa  343  8.999999999999999e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0872973  normal  0.0117476 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0200  elongation factor P  81.38 
 
 		 188 aa  317  9e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324451  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0237  elongation factor P  79.79 
 
 		 188 aa  314  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1958  elongation factor P  78.72 
 
 		 212 aa  308  4e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000139514  normal  0.25468 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2675  elongation factor P  77.13 
 
 		 188 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241431  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0361  elongation factor P  77.13 
 
 		 188 aa  303  7e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4276  translation elongation factor P  49.2 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0449484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3411  elongation factor P  44.39 
 
 		 187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186085  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1531  translation elongation factor P (EF-P)  44.92 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00313257  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1518  elongation factor P  43.32 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1054  elongation factor P  44.32 
 
 		 189 aa  167  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2575  translation elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  157  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0546  translation elongation factor P  40.32 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  38.17 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12650  translation elongation factor P (EF-P)  37.36 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0427626  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  40 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12630  translation elongation factor P (EF-P)  36.56 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.05803 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0847  elongation factor P  40.86 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000412318  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  37.63 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  43.01 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  39.46 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 187 aa  144  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  39.46 
 
 		 185 aa  144  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  37.84 
 
 		 185 aa  145  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  39.46 
 
 		 187 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  37.63 
 
 		 211 aa  143  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  39.57 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2590  translation elongation factor P  40.32 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.993931  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3206  elongation factor P  38.17 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  39.25 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  41.4 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  39.13 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0714  hypothetical protein  39.36 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.469656 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  42.77 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  38.38 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  35.48 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  37.63 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  37.84 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  38.92 
 
 		 186 aa  141  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  37.84 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 187 aa  141  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  39.46 
 
 		 185 aa  141  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  40.54 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4283  translation elongation factor P  37.63 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.496625 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  39.78 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  41.08 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  41.08 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1922  elongation factor P  40.64 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.775944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  39.25 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  43.75 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  40.86 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5247  translation elongation factor P  39.89 
 
 		 187 aa  137  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  36.56 
 
 		 187 aa  137  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1274  elongation factor P  40 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3519  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  136  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.8476e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08176  translation elongation factor P  37.97 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.838989  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2031  translation elongation factor P  36.02 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0283739 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  34.41 
 
 		 187 aa  136  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_002950  PG0568  elongation factor P  40 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  36.56 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  36.56 
 
 		 186 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  38.71 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  35.33 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2333  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0872984  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2651  elongation factor P  38.71 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  38.17 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0356  elongation factor P  39.46 
 
 		 194 aa  135  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  39.46 
 
 		 189 aa  135  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  40 
 
 		 185 aa  135  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  38.38 
 
 		 185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1758  elongation factor P  37.23 
 
 		 188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.141605  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  39.57 
 
 		 188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2128  elongation factor P  37.63 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000767038  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  38.92 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3752  elongation factor P  38.17 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1702  elongation factor P  37.63 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452132  normal  0.100351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2399  elongation factor P  37.63 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  38.67 
 
 		 186 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2358  elongation factor P  37.63 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.69717  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  40.44 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2405  elongation factor P  37.63 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.576459  normal  0.0550099 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0673  translation elongation factor P  38.3 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  36.36 
 
 		 187 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  37.63 
 
 		 189 aa  131  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2499  translation elongation factor P (EF-P)  39.04 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2358  elongation factor P  35.11 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0880785  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  36.76 
 
 		 185 aa  130  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  37.84 
 
 		 189 aa  130  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00301  elongation factor P  38.38 
 
 		 186 aa  130  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2089  elongation factor P  38.71 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0137098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1803  elongation factor P  38.71 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  36.7 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  37.1 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  38.92 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  36.41 
 
 		 187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  38.92 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1061  elongation factor P  40 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>