145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01909 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01909  transport protein  100 
 
 
409 aa  805    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  60.95 
 
 
430 aa  472  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  60.45 
 
 
430 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  55.91 
 
 
414 aa  411  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  36.92 
 
 
417 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  36.05 
 
 
415 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  36.8 
 
 
406 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  34.76 
 
 
415 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  35.89 
 
 
398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  35.54 
 
 
416 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  30.73 
 
 
409 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  32.94 
 
 
401 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  33.97 
 
 
416 aa  151  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  34.85 
 
 
364 aa  149  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  30.94 
 
 
387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  29.59 
 
 
412 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  32.77 
 
 
388 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  34.16 
 
 
365 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  34.29 
 
 
428 aa  139  8.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  31.97 
 
 
414 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2431  hypothetical protein  35.14 
 
 
380 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.503306  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  35.14 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  35.14 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  35.14 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  31.67 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  32.51 
 
 
395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  31.42 
 
 
385 aa  133  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  31.42 
 
 
385 aa  133  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  31.42 
 
 
385 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  31.42 
 
 
385 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  31.49 
 
 
385 aa  132  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  31.42 
 
 
385 aa  132  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  31.59 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  31.59 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  31.13 
 
 
391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  35.15 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2541  hypothetical protein  34.15 
 
 
380 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0379465  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  27.48 
 
 
381 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  26.75 
 
 
381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  31.68 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  32.04 
 
 
459 aa  126  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  27.34 
 
 
381 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  28.74 
 
 
387 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  32.59 
 
 
391 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  25.74 
 
 
381 aa  123  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.82 
 
 
410 aa  122  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.037271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4786  hypothetical protein  30.73 
 
 
406 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6743  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  30.54 
 
 
431 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  35.4 
 
 
410 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  30.07 
 
 
404 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  26.15 
 
 
389 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  33.09 
 
 
392 aa  116  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  28.54 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  25.96 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0371  hypothetical protein  30.9 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  28.37 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  28.94 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  28.12 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  28.94 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  28.12 
 
 
387 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  28.71 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  28.82 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  28.71 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  30.49 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  44.6 
 
 
204 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  27.99 
 
 
415 aa  107  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2469  hypothetical protein  30.45 
 
 
388 aa  106  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2567  hypothetical protein  30.69 
 
 
388 aa  106  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  30.08 
 
 
382 aa  106  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3015  hypothetical protein  30.2 
 
 
388 aa  103  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833892 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  30.34 
 
 
401 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  30.24 
 
 
401 aa  102  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  27.32 
 
 
411 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  28.78 
 
 
414 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  27.07 
 
 
411 aa  96.7  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  27.07 
 
 
411 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  27.07 
 
 
399 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  29 
 
 
414 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  31.53 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1304  hypothetical protein  27.73 
 
 
388 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  27.03 
 
 
401 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  28.12 
 
 
414 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  31.42 
 
 
404 aa  94  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4860  hypothetical protein  30.73 
 
 
387 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138362  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  26.43 
 
 
398 aa  90.9  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  24.75 
 
 
362 aa  90.9  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  27.27 
 
 
397 aa  90.9  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1171  protein of unknown function DUF418  27.16 
 
 
394 aa  87  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  29.25 
 
 
407 aa  87  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  29.98 
 
 
389 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4858  hypothetical protein  23.9 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4921  hypothetical protein  36.96 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0008351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5203  conserved membrane spanning protein  42.02 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4644  hypothetical protein  36.51 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4998  hypothetical protein  36.51 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1646  protein of unknown function DUF405  28.57 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4479  membrane spanning protein  36.51 
 
 
340 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4497  membrane spanning protein  36.51 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  28.78 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0379  hypothetical protein  36.51 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>