163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00288 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00288  transposase  100 
 
 		 94 aa  195  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0187246  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49770  IS4 family transposase  55.88 
 
 		 335 aa  80.1  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26840  Transposase, IS4  55.88 
 
 		 335 aa  80.1  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36450  Transposase, IS4  55.88 
 
 		 335 aa  80.1  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24660  Transposase, IS4  55.88 
 
 		 335 aa  80.1  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16640  Transposase, IS4  55.88 
 
 		 335 aa  80.1  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1196  IS5 family transposase  68.52 
 
 		 334 aa  78.2  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24710  Transposase, IS4  51.47 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1361  transposase IS4 family protein  55 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1665  transposase IS4 family protein  53.97 
 
 		 367 aa  75.9  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114037  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0222  transposase IS4 family protein  56.67 
 
 		 348 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2324  transposase IS4 family protein  55 
 
 		 348 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2450  transposase IS4 family protein  55 
 
 		 348 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.348584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4812  transposase IS4 family protein  55.38 
 
 		 363 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2457  transposase IS4 family protein  52.54 
 
 		 338 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000063174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2638  transposase IS4 family protein  52.54 
 
 		 338 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3091  transposase IS4 family protein  52.54 
 
 		 338 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0337  transposase IS4 family protein  54.72 
 
 		 345 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0260  transposase IS4 family protein  54.72 
 
 		 345 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1943  transposase IS4 family protein  48.48 
 
 		 345 aa  70.5  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0044381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0479  transposase IS4 family protein  48.48 
 
 		 345 aa  70.5  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0712  transposase IS4 family protein  53.33 
 
 		 352 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0318  transposase IS4 family protein  54.72 
 
 		 314 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356657  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2971  IS1246 transposase  50 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0829  transposase IS4 family protein  51.67 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  55.56 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  53.7 
 
 		 360 aa  67.4  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  53.7 
 
 		 360 aa  67.4  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5319  transposase IS4 family protein  46.67 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.316405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1747  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2759  transposase (class II)  46.67 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.195506  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3889  ISMca7, transposase  42.65 
 
 		 213 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0131  transposase, IS4  42.59 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0398  transposase, IS4  42.59 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3293  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0566  transposase, IS4  42.59 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0567  transposase, IS4  42.59 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330478  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0584  transposase, IS4  42.59 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.810717  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0756  transposase, IS4  42.59 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.443512  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0785  transposase, IS4  42.59 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0912  transposase, IS4  42.59 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.216188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0918  transposase, IS4  42.59 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1279  transposase, IS4  42.59 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1446  transposase, IS4  42.59 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1639  transposase, IS4  42.59 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1923  transposase, IS4  42.59 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1991  transposase, IS4  42.59 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2019  transposase, IS4  42.59 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2137  transposase, IS4  42.59 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2160  transposase, IS4  42.59 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2173  transposase, IS4  42.59 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460433  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2442  transposase, IS4  42.59 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  42.65 
 
 		 445 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  42.65 
 
 		 358 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4261  transposase, IS4  42.65 
 
 		 349 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0257321  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  42.65 
 
 		 330 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0854  TIS1021-transposase protein  41.1 
 
 		 349 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1053  TIS1021-transposase protein  41.1 
 
 		 349 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.420746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2444  TIS1021-transposase protein  41.1 
 
 		 337 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2538  TIS1021-transposase protein  41.1 
 
 		 337 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2596  TIS1021-transposase protein  41.1 
 
 		 349 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2600  TIS1021-transposase protein  41.1 
 
 		 349 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.90039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2965  TIS1021-transposase protein  41.1 
 
 		 349 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0493876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2988  TIS1021-transposase protein  41.1 
 
 		 349 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2990  TIS1021-transposase protein  41.1 
 
 		 349 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2992  TIS1021-transposase protein  41.1 
 
 		 349 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3327  TIS1021-transposase protein  41.1 
 
 		 349 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3819  TIS1021-transposase protein  41.1 
 
 		 349 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  46.3 
 
 		 320 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  46.3 
 
 		 320 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  46.3 
 
 		 320 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  46.3 
 
 		 320 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  46.3 
 
 		 320 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  46.3 
 
 		 320 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2350  ISPsy10, transposase, truncation  41.94 
 
 		 212 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  47.17 
 
 		 320 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01862  ISXo1 transposase  46.67 
 
 		 322 aa  45.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854322  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5532  IS4 family transposase  40 
 
 		 320 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04748  ISXo1 transposase  46.67 
 
 		 322 aa  45.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588159  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0714  hypothetical protein  41.94 
 
 		 216 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  35.53 
 
 		 330 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4863  transposase IS4 family protein  43.33 
 
 		 330 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0853188  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0396  transposase IS116/IS110/IS902  37.29 
 
 		 370 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29591 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03194  ISXo1 transposase  39.39 
 
 		 322 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01751  ISXo1 transposase  39.39 
 
 		 322 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06088  ISXo1 transposase  39.39 
 
 		 322 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02738  ISXo1 transposase  39.39 
 
 		 322 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05625  ISXo1 transposase  39.39 
 
 		 322 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0316217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02304  ISXo1 transposase  39.39 
 
 		 322 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0206  TIS1021 transposase  38.1 
 
 		 328 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1179  TIS1021 transposase  38.1 
 
 		 328 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04676  ISXo1 transposase  39.39 
 
 		 322 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04767  ISXo1 transposase  39.39 
 
 		 322 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05516  ISXo1 transposase  39.39 
 
 		 322 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05577  ISXo1 transposase  39.39 
 
 		 322 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04850  ISXo1 transposase  39.39 
 
 		 322 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0577284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00267  ISXo1 transposase  39.39 
 
 		 322 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00278  ISXo1 transposase  39.39 
 
 		 322 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00284  ISXo1 transposase  39.39 
 
 		 322 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.454777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00368  ISXo1 transposase  39.39 
 
 		 322 aa  44.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.161909  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00491  ISXo1 transposase  39.39 
 
 		 322 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>