More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00149 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0086  recombinase A  90.41 
 
 		 347 aa  634    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000139683  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0100  recombinase A  90.7 
 
 		 347 aa  636    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00149  recombinase A  100 
 
 		 344 aa  690    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781257  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1476  recombinase A  94.33 
 
 		 345 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158308  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  76.97 
 
 		 348 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  75.68 
 
 		 348 aa  516  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  75.68 
 
 		 348 aa  516  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  74.48 
 
 		 342 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  72.73 
 
 		 347 aa  512  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  74.57 
 
 		 347 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  76.69 
 
 		 345 aa  509  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1287  recombinase A  76.79 
 
 		 343 aa  502  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.569427  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  73.16 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  73.16 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  73.16 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  73.16 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  74.04 
 
 		 357 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  72.86 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0570  recombinase A  75.07 
 
 		 344 aa  500  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.244041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  76.31 
 
 		 358 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  73.16 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1483  recombinase A  76.19 
 
 		 347 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  73.16 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  72.34 
 
 		 362 aa  499  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  73.16 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  73.37 
 
 		 359 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  73.16 
 
 		 348 aa  494  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  71.12 
 
 		 363 aa  495  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  73.25 
 
 		 343 aa  494  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  73.37 
 
 		 359 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  73.25 
 
 		 343 aa  494  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  75.69 
 
 		 358 aa  494  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  70.09 
 
 		 346 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  73.62 
 
 		 345 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  73.62 
 
 		 345 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  71.56 
 
 		 347 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  71.72 
 
 		 356 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  71.63 
 
 		 356 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  73.02 
 
 		 358 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  70.09 
 
 		 346 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  71.63 
 
 		 356 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  70.32 
 
 		 349 aa  491  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  72.87 
 
 		 349 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  71.65 
 
 		 348 aa  488  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03513  recombinase A  70.03 
 
 		 354 aa  491  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  71.04 
 
 		 355 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  68.29 
 
 		 362 aa  486  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  68.97 
 
 		 352 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  71.17 
 
 		 354 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  71.04 
 
 		 355 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0466  recombinase A  76.09 
 
 		 353 aa  484  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  70.69 
 
 		 355 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  71.04 
 
 		 355 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0634  recombinase A  71.17 
 
 		 347 aa  487  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  70.86 
 
 		 361 aa  483  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  70.73 
 
 		 354 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  70.73 
 
 		 354 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0527  recombinase A  75.47 
 
 		 353 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000554316  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  71.17 
 
 		 362 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  70.86 
 
 		 424 aa  483  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1655  recombinase A  71.79 
 
 		 354 aa  483  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.384834  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002519  RecA protein  71.17 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  70.86 
 
 		 361 aa  481  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  67.73 
 
 		 347 aa  482  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  70.55 
 
 		 364 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  69.82 
 
 		 345 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4152  recombinase A  73.47 
 
 		 343 aa  478  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  72.24 
 
 		 365 aa  480  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  71.43 
 
 		 357 aa  478  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  70.52 
 
 		 384 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  70.25 
 
 		 362 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  70.46 
 
 		 348 aa  478  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3259  recombinase A  72.33 
 
 		 343 aa  480  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02549  recombinase A  67.73 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3946  recombinase A  67.73 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44116  normal  0.835205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0471  recombinase A  71.51 
 
 		 352 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0551  recombinase A  75.72 
 
 		 352 aa  474  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2822  recombinase A  67.73 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0783343  decreased coverage  0.0000036093 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3178  recombinase A  67.73 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0943419  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3015  recombinase A  68.31 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  decreased coverage  0.0000000499102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0455  recombinase A  71.51 
 
 		 352 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1013  recombinase A  67.73 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.580458  unclonable  0.0000000301114 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02514  hypothetical protein  67.73 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302057  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  69.54 
 
 		 363 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1208  recombinase A  67.85 
 
 		 353 aa  474  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3031  recombinase A  68.31 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00473022  hitchhiker  0.000967818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  70.46 
 
 		 362 aa  476  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  66.29 
 
 		 362 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2980  recombinase A  68.31 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.200628  decreased coverage  0.0000974758 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2835  recombinase A  67.73 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  69.63 
 
 		 360 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  71.69 
 
 		 343 aa  477  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2948  recombinase A  68.31 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1125  recombinase A  66.76 
 
 		 357 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1196  recombinase A  66.76 
 
 		 357 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3138  recombinase A  68.31 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  69.54 
 
 		 361 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  70.77 
 
 		 355 aa  475  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2983  recombinase A  67.73 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0313902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3430  recombinase A  66.18 
 
 		 357 aa  471  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>