134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4289 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4289  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3992  hypothetical protein  82.93 
 
 		 237 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  43.02 
 
 		 250 aa  141  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  50.71 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  43.68 
 
 		 260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  41.83 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  39.42 
 
 		 315 aa  105  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  40.91 
 
 		 261 aa  101  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  40.91 
 
 		 261 aa  101  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  35.12 
 
 		 299 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  37.67 
 
 		 235 aa  99.4  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  37.96 
 
 		 315 aa  99.4  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  40.15 
 
 		 262 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  98.2  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  98.2  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4747  hypothetical protein  38.06 
 
 		 251 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  37.7 
 
 		 270 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  35.29 
 
 		 302 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  36.76 
 
 		 315 aa  94  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1222  protein of unknown function DUF477  40.15 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  39.42 
 
 		 265 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1334  hypothetical protein  31.76 
 
 		 290 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  40.77 
 
 		 166 aa  92.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  31.71 
 
 		 294 aa  91.7  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  33.56 
 
 		 307 aa  91.3  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2118  hypothetical protein  32.94 
 
 		 336 aa  91.3  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  36.84 
 
 		 246 aa  89  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  37.06 
 
 		 299 aa  89  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  31.76 
 
 		 301 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  33.33 
 
 		 246 aa  86.3  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0897  hypothetical protein  30.17 
 
 		 284 aa  84.7  8e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.803851  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  34.29 
 
 		 295 aa  84.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  33.57 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  33.58 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  36.84 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  32.87 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  34.27 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  32.41 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  32.17 
 
 		 259 aa  81.6  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  32.33 
 
 		 229 aa  81.3  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  34.97 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3453  hypothetical protein  38.39 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529474  normal  0.0920314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  33.83 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0990  hypothetical protein  36.29 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3481  hypothetical protein  32.08 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  35.04 
 
 		 260 aa  78.2  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0330  hypothetical protein  29.41 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  32.39 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1670  hypothetical protein  34.52 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1255  protein of unknown function DUF477  33.08 
 
 		 302 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0178341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0258  hypothetical protein  31.43 
 
 		 310 aa  74.7  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.734577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04780  hypothetical protein  25.78 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4334  protein of unknown function DUF477  29.13 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.82734 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0878  hypothetical protein  34.38 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236831  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2160  hypothetical protein  30.23 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  30.3 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  28.79 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  31.75 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24940  methanol dehydrogenase  32.88 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  29.21 
 
 		 279 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  27.57 
 
 		 288 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  28.22 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  25.96 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1889  hypothetical protein  27.69 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  31.58 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  30.07 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  30.07 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2693  hypothetical protein  31.69 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1787  hypothetical protein  33.61 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000129243  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1830  hypothetical protein  33.61 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1073  hypothetical protein  30 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3877  hypothetical protein  33.08 
 
 		 422 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  25.74 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45700  hypothetical protein  31.78 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  31.5 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0875  protein of unknown function DUF477  32.52 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000594367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0103  hypothetical protein  26.22 
 
 		 306 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.504217  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  28.08 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  29.37 
 
 		 277 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45710  hypothetical protein  33.08 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0327  putative lipoprotein  29.29 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  30.71 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  28.67 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0509  putative lipoprotein  29.29 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1821  protein of unknown function DUF477  29.57 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367248  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  27.81 
 
 		 286 aa  65.1  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3371  putative lipoprotein  29.29 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3041  putative lipoprotein  29.29 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2051  putative lipoprotein  29.29 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0314  putative lipoprotein  29.29 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2233  putative lipoprotein  29.29 
 
 		 282 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3702  hypothetical protein  28.46 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83448  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0285  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1401  protein of unknown function DUF477  25.68 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0146  hypothetical protein  30.83 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04652  glycine rich protein  30.71 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00734388  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0998  protein of unknown function DUF477  25.73 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0659  protein of unknown function DUF477  26.49 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1720  hypothetical protein  31.15 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3082  hypothetical protein  26.99 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000317552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>