95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0706 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  100 
 
 		 253 aa  520  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  88.8 
 
 		 253 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  42.11 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  41.53 
 
 		 494 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  41.7 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  40 
 
 		 504 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  40.16 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  31.3 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  29.82 
 
 		 241 aa  119  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  28.82 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0709  hypothetical protein  30.88 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  30.46 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  31.62 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2750  hypothetical protein  31.56 
 
 		 258 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  30.49 
 
 		 254 aa  101  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  30.09 
 
 		 331 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  31.38 
 
 		 267 aa  95.9  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  29.63 
 
 		 331 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  30.09 
 
 		 330 aa  92  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  26.48 
 
 		 529 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  28.7 
 
 		 329 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  29.15 
 
 		 548 aa  85.9  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  28.96 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  28.69 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  28.16 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  29.55 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.43 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  27.5 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1800  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.6322  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0020  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.13 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.583446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  24.22 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  26.51 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  21.88 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  29.82 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  24.37 
 
 		 325 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  24.58 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.58 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  28.44 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2596  dolichyl-phosphate mannose synthase  28.05 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  26.27 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  23.63 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  25.56 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.75 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0729  Nucleotidyl transferase  26.58 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2465  hypothetical protein  26.18 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  27.65 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.31 
 
 		 331 aa  52.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0890  nucleotidyl transferase  26.52 
 
 		 359 aa  52  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0928  nucleotidyl transferase  25.56 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.20613 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  25.57 
 
 		 854 aa  50.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  27.27 
 
 		 370 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  27.62 
 
 		 358 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1604  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.59 
 
 		 493 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.610155  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.33 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  24.04 
 
 		 364 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  22.71 
 
 		 835 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  26.75 
 
 		 364 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.29 
 
 		 355 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  26.7 
 
 		 370 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  27.62 
 
 		 842 aa  46.6  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0378  Nucleotidyl transferase  24.42 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0925402 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0639  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.07 
 
 		 447 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0152266  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.65 
 
 		 358 aa  45.8  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1620  nucleotidyl transferase  26.67 
 
 		 360 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.64 
 
 		 355 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1890  nucleotidyl transferase  26.37 
 
 		 357 aa  45.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5632  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  29.01 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  25.7 
 
 		 403 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.57 
 
 		 355 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  23.83 
 
 		 392 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  22.6 
 
 		 835 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.39 
 
 		 354 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  25.41 
 
 		 830 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0178  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.78 
 
 		 470 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.35 
 
 		 354 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  24.09 
 
 		 357 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.94 
 
 		 355 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  23.87 
 
 		 833 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  24.35 
 
 		 392 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  23.83 
 
 		 392 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.46 
 
 		 357 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  23.83 
 
 		 392 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  24.77 
 
 		 348 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.34 
 
 		 376 aa  43.9  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25 
 
 		 359 aa  43.5  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18871  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25.81 
 
 		 470 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.33386 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.03 
 
 		 357 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.11 
 
 		 405 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  23.7 
 
 		 842 aa  42.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  25.77 
 
 		 388 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  24.35 
 
 		 388 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  26.95 
 
 		 366 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  22.73 
 
 		 392 aa  42.4  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.44 
 
 		 453 aa  42  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405845 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  22.86 
 
 		 238 aa  42  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>