57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0206 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  330  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3123  hypothetical protein  45.71 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5186  hypothetical protein  52.34 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  34.43 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  34.96 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  44.57 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  32.48 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  34.41 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  30.16 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  38.1 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  31.37 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  30.19 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  35.16 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  30.19 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1396  hypothetical protein  32.47 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  29.52 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  31.76 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  33.71 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  37.68 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  37.68 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  29.49 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  35.21 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  35.14 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  33.67 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  29.69 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  33.67 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  36.21 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  32.93 
 
 		 145 aa  47.8  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2273  hypothetical protein  38.6 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0784666  hitchhiker  0.00253392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  28.35 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  27.47 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  30.61 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  27.97 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4183  hypothetical protein  38.46 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  25.89 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  31.33 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  32.93 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5846  hypothetical protein  41.18 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  30.49 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  30.93 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  30.12 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2069  hypothetical protein  35.09 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.473334  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6001  hypothetical protein  32.26 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  30.12 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  30.12 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  30.12 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  30.12 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  30.12 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  31.71 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  30.88 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  27.84 
 
 		 138 aa  41.2  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  29.27 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5233  hypothetical protein  25.81 
 
 		 142 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  26.19 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  28.17 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>