More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3322 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3322  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 333 aa  684    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0181  delta-aminolevulinic acid dehydratase  71.77 
 
 		 331 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3352  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.47 
 
 		 331 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  0.803387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.28 
 
 		 350 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.58 
 
 		 350 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.28 
 
 		 352 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.11 
 
 		 350 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3924  Porphobilinogen synthase  64.16 
 
 		 329 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0861463  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.13 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.41 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.72 
 
 		 378 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.67 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.76 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.37 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1546  Porphobilinogen synthase  60.6 
 
 		 353 aa  378  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.37 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2897  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.7 
 
 		 335 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.713328  hitchhiker  0.000481254 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.37 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.63 
 
 		 360 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.67 
 
 		 351 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6834  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.02 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.28 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.578542  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.62 
 
 		 334 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1172  Porphobilinogen synthase  59.87 
 
 		 336 aa  360  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.67 
 
 		 343 aa  358  5e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.98 
 
 		 352 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.82 
 
 		 335 aa  355  6.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0080  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.41 
 
 		 342 aa  353  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000790962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0380  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.4 
 
 		 355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3267  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.34 
 
 		 331 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0833553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2989  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.88 
 
 		 331 aa  352  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.64 
 
 		 336 aa  352  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.88 
 
 		 331 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3859  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.77 
 
 		 329 aa  352  5e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0982142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0083  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.54 
 
 		 341 aa  352  5e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.88 
 
 		 330 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0812  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.49 
 
 		 337 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.4 
 
 		 335 aa  352  7e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5465  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.2 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47450  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.87 
 
 		 337 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0518  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.86 
 
 		 338 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.151738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.81 
 
 		 332 aa  350  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00963243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4105  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.64 
 
 		 338 aa  350  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0404345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.86 
 
 		 337 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3382  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.97 
 
 		 338 aa  350  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.07 
 
 		 335 aa  349  3e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5987  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.53 
 
 		 337 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.99 
 
 		 336 aa  349  4e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.73 
 
 		 330 aa  348  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.72 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3211  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.97 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1113  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.61 
 
 		 337 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2464  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.61 
 
 		 335 aa  347  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.72 
 
 		 354 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.72 
 
 		 354 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.72 
 
 		 362 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1532  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.8 
 
 		 338 aa  346  4e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0299  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.27 
 
 		 337 aa  346  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.231605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.72 
 
 		 335 aa  346  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.28 
 
 		 362 aa  345  6e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.59 
 
 		 332 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.59 
 
 		 332 aa  345  7e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.43 
 
 		 338 aa  345  8e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5251  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.86 
 
 		 336 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2079  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.21 
 
 		 334 aa  344  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.117001  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.59 
 
 		 332 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2413  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.63 
 
 		 347 aa  344  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0292  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.19 
 
 		 336 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.25 
 
 		 332 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1262  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.95 
 
 		 337 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.818694  normal  0.345266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.36 
 
 		 332 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0113422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.39 
 
 		 329 aa  343  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4219  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.45 
 
 		 333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0548  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.73 
 
 		 340 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1547  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.11 
 
 		 326 aa  343  2.9999999999999997e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1129  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.14 
 
 		 343 aa  342  4e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.25 
 
 		 332 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.25 
 
 		 334 aa  342  5.999999999999999e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.25 
 
 		 332 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.25 
 
 		 332 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0626  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.14 
 
 		 334 aa  341  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.727546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0245  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.08 
 
 		 349 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.963714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.9 
 
 		 332 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.46 
 
 		 345 aa  341  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1837  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0278  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.22 
 
 		 340 aa  339  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3938  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.22 
 
 		 340 aa  339  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1907  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.22 
 
 		 340 aa  339  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.7 
 
 		 333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001919  porphobilinogen synthase  55.33 
 
 		 354 aa  338  5.9999999999999996e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.874954  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57 
 
 		 334 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3004  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.51 
 
 		 321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214609 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2280  Porphobilinogen synthase  56.31 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.668376  normal  0.0129462 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0357  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.15 
 
 		 321 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.39 
 
 		 338 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.1 
 
 		 343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.019556 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02814  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.14 
 
 		 320 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.04 
 
 		 335 aa  334  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0436  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.64 
 
 		 335 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0138648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>