More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0269 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1101  glutamate synthase (NADPH)  77.24 
 
 		 539 aa  884    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0610737  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0269  glutamate synthase, large subunit, putative  100 
 
 		 555 aa  1141    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171701  hitchhiker  0.00246171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1060  glutamate synthase, large subunit, putative  77.05 
 
 		 539 aa  882    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0213499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0827  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.91 
 
 		 541 aa  649    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0473902 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2722  putative signal peptide protein  63.18 
 
 		 532 aa  690    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.600184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0474  ferredoxin-dependent glutamate synthase  61.24 
 
 		 543 aa  659    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185705  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4352  glutamate synthase (NADPH)  76.87 
 
 		 539 aa  881    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2046  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.47 
 
 		 547 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2546  glutamate synthase (NADPH)  64.72 
 
 		 537 aa  696    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.341108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1432  Glutamate synthase (NADPH)  61.93 
 
 		 540 aa  655    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0688  ferredoxin-dependent glutamate synthase  64.1 
 
 		 536 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0348846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2966  ferredoxin-dependent glutamate synthase  63.91 
 
 		 532 aa  684    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2363  glutamate synthase domain-containing protein  65.5 
 
 		 526 aa  693    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2543  glutamate synthase domain-containing protein  65.5 
 
 		 526 aa  693    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1139  glutamate synthase domain-containing protein  65.5 
 
 		 526 aa  693    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3397  glutamate synthase domain-containing protein  66.21 
 
 		 557 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4939  glutamate synthase (NADPH)  93.15 
 
 		 553 aa  1060    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780315  hitchhiker  0.000000214138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4559  ferredoxin-dependent glutamate synthase  76.48 
 
 		 539 aa  885    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3783  glutamate synthase (NADPH)  63.69 
 
 		 539 aa  678    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1544  glutamate synthase (NADPH)  77.34 
 
 		 536 aa  869    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443083  normal  0.726905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4784  glutamate synthase (NADPH)  70.15 
 
 		 532 aa  778    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690786  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3355  glutamate synthase  66.21 
 
 		 546 aa  694    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2687  glutamate synthase (NADPH)  65.94 
 
 		 539 aa  683    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.139816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0277  glutamate synthase domain-containing protein  65.81 
 
 		 586 aa  692    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1256  glutamate synthase domain-containing protein  66.01 
 
 		 557 aa  695    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1907  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.76 
 
 		 581 aa  656    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0566  ferredoxin-dependent glutamate synthase  62.55 
 
 		 543 aa  664    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212198  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0295  glutamate synthase (NADPH)  96.94 
 
 		 555 aa  1113    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3073  ferredoxin-dependent glutamate synthase  57.92 
 
 		 572 aa  642    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0761319  normal  0.821908 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0616  glutamate synthase (NADPH)  65.08 
 
 		 539 aa  684    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.2904 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0478  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.14 
 
 		 572 aa  686    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4011  glutamate synthase (NADPH)  64.1 
 
 		 536 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2019  putative glutamate synthase [NADPH] large chain  59.47 
 
 		 535 aa  657    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.054741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0262  ferredoxin-dependent glutamate synthase  60.53 
 
 		 543 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1303  ferredoxin-dependent glutamate synthase  66.73 
 
 		 547 aa  760    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.95 
 
 		 541 aa  652    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0813  glutamate synthase (NADPH)  60.96 
 
 		 600 aa  655    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.279558 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3390  glutamate synthase  66.21 
 
 		 546 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0213  glutamate synthase (NADPH)  65.08 
 
 		 539 aa  680    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1210  glutamate synthase (NADPH)  57.57 
 
 		 546 aa  638    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0664  glutamate synthase (NADPH)  65.08 
 
 		 539 aa  681    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2556  ferredoxin-dependent glutamate synthase  61.19 
 
 		 532 aa  680    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50767  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25670  glutamate synthase  75.47 
 
 		 537 aa  797    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1090  glutamate synthase (NADPH)  77.99 
 
 		 539 aa  888    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.401146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0590  glutamate synthase (NADPH)  64.88 
 
 		 539 aa  683    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17690  hypothetical protein  77.82 
 
 		 536 aa  871    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00127329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0285  glutamate synthase (NADPH)  96.76 
 
 		 556 aa  1103    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0697  glutamate synthase (NADPH)  65.08 
 
 		 539 aa  682    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1516  ferredoxin-dependent glutamate synthase  69.92 
 
 		 540 aa  768    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.852004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1539  hypothetical protein  77.63 
 
 		 546 aa  856    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0710  ferredoxin-dependent glutamate synthase  58.6 
 
 		 551 aa  655    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.672119 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3620  putative glutamate synthase  58.27 
 
 		 554 aa  641    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.084141  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2031  ferredoxin-dependent glutamate synthase  56.82 
 
 		 577 aa  628  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7493  glutamate synthase domain-containing protein  59.62 
 
 		 541 aa  629  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.908269  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0235  ferredoxin-dependent glutamate synthase  57.69 
 
 		 553 aa  627  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.948942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0567  ferredoxin-dependent glutamate synthase  61.86 
 
 		 541 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0803  ferredoxin-dependent glutamate synthase  59.27 
 
 		 541 aa  595  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.34 
 
 		 526 aa  574  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2312  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.89 
 
 		 527 aa  568  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3407  Glutamate synthase (NADPH)  54.18 
 
 		 533 aa  565  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1352  glutamate synthase domain-containing protein  52.21 
 
 		 550 aa  559  1e-158  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1291  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.93 
 
 		 550 aa  558  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.256272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3020  Glutamate synthase (NADPH)  51.98 
 
 		 564 aa  556  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0605315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2792  Glutamate synthase (NADPH)  55.65 
 
 		 526 aa  555  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0101  ferredoxin-dependent glutamate synthase  54.76 
 
 		 551 aa  551  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  51.79 
 
 		 543 aa  546  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.86 
 
 		 542 aa  543  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0076  hypothetical protein  49.62 
 
 		 523 aa  538  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0088  hypothetical protein  49.43 
 
 		 523 aa  536  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4202  ferredoxin-dependent glutamate synthase  53.65 
 
 		 529 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.359651  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2913  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.8 
 
 		 529 aa  525  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.57199 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1659  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.67 
 
 		 557 aa  527  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001393  normal  0.49498 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19410  glutamate synthase family protein  53.09 
 
 		 670 aa  527  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1434  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.12 
 
 		 543 aa  524  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505449  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1841  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.53 
 
 		 547 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000190158  normal  0.0323179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1794  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.59 
 
 		 550 aa  519  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1485  Glutamate synthase (NADPH)  49.11 
 
 		 519 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0160  glutamate synthase domain-containing protein  52.8 
 
 		 548 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3206  glutamate synthase domain-containing protein  52.35 
 
 		 555 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2306  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.05 
 
 		 499 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0629171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2032  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.31 
 
 		 469 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2409  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.04 
 
 		 504 aa  491  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.550103  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1995  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.83 
 
 		 530 aa  363  4e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000483561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0316  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.59 
 
 		 500 aa  360  5e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3307  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.7 
 
 		 520 aa  355  7.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5333  ferredoxin-dependent glutamate synthase  44.2 
 
 		 534 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.64 
 
 		 534 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  44.2 
 
 		 534 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5847  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.71 
 
 		 534 aa  352  8.999999999999999e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0988  ferredoxin-dependent glutamate synthase  42.92 
 
 		 533 aa  349  6e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0867  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.3 
 
 		 507 aa  348  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1542  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.82 
 
 		 493 aa  347  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5008  ferredoxin-dependent glutamate synthase  39.59 
 
 		 531 aa  347  4e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1911  glutamate synthase, putative  41.13 
 
 		 511 aa  347  4e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3353  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.85 
 
 		 496 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0600  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.85 
 
 		 496 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3233  ferredoxin-dependent glutamate synthase  40.17 
 
 		 496 aa  345  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2152  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.57 
 
 		 524 aa  345  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3523  ferredoxin-dependent glutamate synthase  41.06 
 
 		 496 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12620  glutamate synthase family protein  42.95 
 
 		 522 aa  343  5e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0776203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>