More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0805 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  88.24 
 
 		 306 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  87.91 
 
 		 306 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  80.72 
 
 		 306 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  48.52 
 
 		 341 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  49.83 
 
 		 306 aa  333  2e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  52.79 
 
 		 307 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  52.13 
 
 		 307 aa  325  8.000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  47.51 
 
 		 301 aa  323  2e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  50 
 
 		 323 aa  308  8e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  43.9 
 
 		 313 aa  290  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.71 
 
 		 309 aa  281  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.52 
 
 		 311 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.02 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.02 
 
 		 310 aa  269  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  42.44 
 
 		 313 aa  269  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.04 
 
 		 310 aa  264  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  34.75 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43121  predicted protein  28.98 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154535 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43341  predicted protein  28.98 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269246 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43169  predicted protein  27.5 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0856686  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.31 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2968  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 		 333 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.77 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 341 aa  82.4  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  27.02 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.31 
 
 		 330 aa  79  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  28.11 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0323  UDP-glucose 4-epimerase  26.71 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.428855  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.59 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  27.71 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.57 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  27.42 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.98 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  27.64 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  26.61 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  26.61 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.22 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5572  hypothetical protein  30.29 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.84 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.66 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  25.91 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  26.61 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4700  NAD dependent epimerase/dehydratase family  24.8 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.55 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.21 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000773597 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  23.89 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0308  UDP-glucose 4-epimerase  25.47 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.41 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.07 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.9 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.21 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.75 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  24.68 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.3 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.51 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1066  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.01 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.38 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  30.27 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0257  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.44 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0338  UDP-glucose 4-epimerase  25 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5580  hypothetical protein  28.96 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23.82 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.08 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045189 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.55 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.73 
 
 		 314 aa  67  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  22.94 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5628  hypothetical protein  28.96 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.23 
 
 		 322 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000549333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0303  UDP-glucose 4-epimerase, putative  24.38 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  30.27 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.74 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.54 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5377  hypothetical protein  29.22 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00568321  normal  0.0173928 
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.8 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.02 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.68 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  30.27 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5128  hypothetical protein  27.87 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.71 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  20.35 
 
 		 619 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.56 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>