136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89240 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  60.75 
 
 		 184 aa  225  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  55.76 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  50.27 
 
 		 183 aa  180  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  48.85 
 
 		 185 aa  171  5.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  35.66 
 
 		 153 aa  90.1  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  38.1 
 
 		 153 aa  89.4  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  31.97 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  38.46 
 
 		 152 aa  86.3  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  36.15 
 
 		 156 aa  85.9  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  30.67 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  33.56 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  33.56 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  33.56 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  33.81 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  30.77 
 
 		 151 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  33.33 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  31.13 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  30.43 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  28.99 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  32.06 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  28.99 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  31.72 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  34.11 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  32.62 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  32.14 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  26.14 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  29.25 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  28.57 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  28.99 
 
 		 185 aa  62  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  31.21 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  26.04 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  29.71 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  32.18 
 
 		 116 aa  51.6  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  28.29 
 
 		 159 aa  49.7  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  28.29 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0772  ribosomal protein L22  31.45 
 
 		 115 aa  47.8  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0420654  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  36 
 
 		 121 aa  47.8  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1760  50S ribosomal protein L22  27.14 
 
 		 112 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0923883  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  27.14 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  39.44 
 
 		 115 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  38.03 
 
 		 111 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  28.85 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0785  50S ribosomal protein L22  38.03 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.363431  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  34.29 
 
 		 110 aa  45.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  34.29 
 
 		 110 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  34.29 
 
 		 110 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  34.29 
 
 		 110 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  36.62 
 
 		 110 aa  45.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  34.29 
 
 		 110 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  34.29 
 
 		 110 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  34.29 
 
 		 110 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  34.29 
 
 		 110 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  34.29 
 
 		 110 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  33.8 
 
 		 110 aa  45.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  34.29 
 
 		 110 aa  45.1  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  39.44 
 
 		 110 aa  45.1  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 		 110 aa  44.7  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  36.14 
 
 		 146 aa  44.7  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  36.76 
 
 		 110 aa  44.7  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1849  50S ribosomal protein L22  35.37 
 
 		 115 aa  44.7  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000192046  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  32.86 
 
 		 110 aa  44.7  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  32.86 
 
 		 110 aa  44.7  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  25.71 
 
 		 114 aa  44.7  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0342  50S ribosomal protein L22  35.37 
 
 		 115 aa  44.7  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000162922  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  32.86 
 
 		 110 aa  44.7  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000490323  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  34.09 
 
 		 113 aa  44.7  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  27.34 
 
 		 111 aa  44.7  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  34.29 
 
 		 110 aa  44.7  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0399  50S ribosomal protein L22  36.11 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0374  50S ribosomal protein L22  36.11 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  32.86 
 
 		 110 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2164  ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 112 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.135391 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0986  ribosomal protein L22  27.86 
 
 		 114 aa  44.3  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.631891  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  26.62 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 110 aa  42.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3519  ribosomal protein L22  31.43 
 
 		 111 aa  42.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000743779  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0724  50S ribosomal protein L22  36.62 
 
 		 110 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000976773  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 110 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 110 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 110 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 110 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 110 aa  42.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 110 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3333  50S ribosomal protein L22  38.67 
 
 		 109 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000899002  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0055  50S ribosomal protein L22  36.23 
 
 		 111 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000185707  hitchhiker  6.04207e-20 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  35.29 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  32.95 
 
 		 113 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0333  ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  31.43 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 110 aa  42.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>