More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51357 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_51357  thioredoxin m  100 
 
 
200 aa  409  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  48.39 
 
 
109 aa  101  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  46.15 
 
 
107 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  48.35 
 
 
107 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  46.15 
 
 
107 aa  95.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  45.05 
 
 
124 aa  95.1  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  47.25 
 
 
107 aa  94.7  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  45.05 
 
 
107 aa  94.4  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  45.05 
 
 
107 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  45.05 
 
 
107 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  47.25 
 
 
107 aa  94  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  46.15 
 
 
107 aa  93.2  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  43.96 
 
 
107 aa  92  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  43.96 
 
 
107 aa  92  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  45.05 
 
 
107 aa  91.7  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  45.05 
 
 
107 aa  91.3  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  43.82 
 
 
148 aa  91.3  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  45.05 
 
 
107 aa  91.3  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  45.05 
 
 
107 aa  91.3  8e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  36.44 
 
 
123 aa  89.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  42.86 
 
 
107 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  42.86 
 
 
125 aa  88.6  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  41.35 
 
 
113 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  46.43 
 
 
108 aa  83.6  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  41.67 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  43.37 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  40.66 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  40.66 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  34.65 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  40.66 
 
 
106 aa  80.5  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  43.53 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  40.86 
 
 
110 aa  79  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  37 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  35.29 
 
 
110 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  41.67 
 
 
107 aa  77.4  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  35.16 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  40 
 
 
108 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  41.67 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  40.48 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  36.26 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  36.26 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  37.63 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  41.67 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  34.45 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  34.65 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  37.08 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  33.33 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  29.79 
 
 
453 aa  75.5  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  42.17 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  36.78 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  38.82 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  36.26 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  33.33 
 
 
104 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  36.26 
 
 
107 aa  73.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  36.36 
 
 
108 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  34.34 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  32.35 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  34.07 
 
 
105 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  36.17 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  37.36 
 
 
107 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  25.95 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  37.04 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  36 
 
 
106 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  32.31 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  34.07 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  33.64 
 
 
104 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  37.36 
 
 
110 aa  73.6  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  31.37 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  41.46 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  37.11 
 
 
103 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  32.26 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  28.12 
 
 
460 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  33.33 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  35.16 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  34.94 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  34.69 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  32.41 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  35.16 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  38.71 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  39.29 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  36.26 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  33.33 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  32.26 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  32.26 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  36 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  35.16 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  42.17 
 
 
108 aa  72.4  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  30.69 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  29.06 
 
 
334 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  36.11 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  31.31 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  32.67 
 
 
280 aa  72  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  32.35 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  34.29 
 
 
109 aa  72  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  30.69 
 
 
324 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  34.07 
 
 
108 aa  72  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  35.16 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  32.71 
 
 
104 aa  72  0.000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  38.1 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  34.29 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>