More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50671 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  100 
 
 
407 aa  833    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  53.88 
 
 
410 aa  432  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  53.79 
 
 
368 aa  379  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  50.66 
 
 
373 aa  373  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  52.09 
 
 
367 aa  371  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  53.81 
 
 
367 aa  368  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  49.48 
 
 
367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  48.4 
 
 
374 aa  349  6e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  49.21 
 
 
368 aa  342  7e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  49.73 
 
 
378 aa  332  6e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  43.6 
 
 
367 aa  319  6e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  43.24 
 
 
364 aa  311  9e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  43.41 
 
 
370 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.16 
 
 
370 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  44.18 
 
 
369 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  43.65 
 
 
363 aa  301  1e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  44.21 
 
 
371 aa  299  5e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  44.96 
 
 
371 aa  298  8e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  45.05 
 
 
369 aa  294  2e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  43.75 
 
 
369 aa  287  2e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  43.49 
 
 
369 aa  286  4e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  43.72 
 
 
370 aa  285  8e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  43.49 
 
 
369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  38.68 
 
 
365 aa  258  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  40.72 
 
 
369 aa  247  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  39.47 
 
 
370 aa  243  6e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  41.34 
 
 
370 aa  232  8.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  39.43 
 
 
368 aa  223  6e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  40 
 
 
371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  35.99 
 
 
346 aa  209  6e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  27.03 
 
 
380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  27.78 
 
 
389 aa  125  9e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  27.88 
 
 
389 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  29.55 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  27.03 
 
 
387 aa  114  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  26.67 
 
 
351 aa  107  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  26.2 
 
 
357 aa  102  9e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  27.19 
 
 
387 aa  100  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  29.53 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  36.51 
 
 
437 aa  77.4  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.4 
 
 
368 aa  77  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  36.89 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  36.72 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl522  GTPase ObgE  36.22 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  38.21 
 
 
347 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  33.88 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  37.61 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  30.34 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  30.43 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  37.4 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1586  GTPase ObgE  29.95 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0414808  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  35.59 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.37 
 
 
463 aa  73.6  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.16 
 
 
437 aa  73.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  35.25 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0810  GTPase ObgE  29.51 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0769748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  36.07 
 
 
529 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.02 
 
 
416 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.53 
 
 
438 aa  72  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.52 
 
 
427 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0532  GTPase ObgE  33.33 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114887  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2389  GTPase ObgE  36.07 
 
 
529 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045234  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0100  GTPase ObgE  37.4 
 
 
345 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  34.92 
 
 
344 aa  72  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.1 
 
 
359 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.68 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  32.79 
 
 
515 aa  71.2  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  37.14 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.19 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1748  GTPase ObgE  38.21 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0657373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.25 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  35.94 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.54 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  33.06 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  36.75 
 
 
428 aa  70.1  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  33.61 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0131  GTPase ObgE  35.77 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  36.54 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  36 
 
 
432 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  37.72 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0091  GTPase ObgE  35.77 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2458  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.8 
 
 
450 aa  69.7  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  33.61 
 
 
335 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.06 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.4 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf270  GTPase ObgE  33.6 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.320591  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  40.37 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.65 
 
 
517 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  27.85 
 
 
328 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0312  GTP-binding protein Obg/CgtA  36 
 
 
432 aa  68.2  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  31.71 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02481  GTPase ObgE  28.26 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  35.2 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  33.88 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  28.25 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  36 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.87 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.87 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  34.92 
 
 
427 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  36.17 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>