66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47094 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_47094  predicted protein  100 
 
 		 503 aa  1057    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_3060  predicted protein  33.14 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.206644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44277  predicted protein  30.22 
 
 		 368 aa  131  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10962  interstrand crosslink repair protein (Eurofung)  25.85 
 
 		 832 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32290  predicted protein  28.34 
 
 		 684 aa  109  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56782  predicted protein  26.61 
 
 		 628 aa  90.5  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04070  conserved hypothetical protein  34.41 
 
 		 811 aa  82.4  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.96924  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01200  expressed protein  22.73 
 
 		 758 aa  68.6  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40815  predicted protein  30.67 
 
 		 182 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0533421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.02 
 
 		 466 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  22.27 
 
 		 414 aa  55.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  26.25 
 
 		 467 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  25.76 
 
 		 411 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 411 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 		 640 aa  52  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.39 
 
 		 466 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 470 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  24.38 
 
 		 634 aa  50.8  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  23.38 
 
 		 635 aa  50.4  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_17702  predicted protein  26.45 
 
 		 411 aa  50.4  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.257016 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  23.71 
 
 		 639 aa  50.4  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  22.74 
 
 		 554 aa  50.1  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 		 460 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  25.5 
 
 		 468 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 		 821 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.92 
 
 		 467 aa  47.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  29.59 
 
 		 485 aa  47.8  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  24.11 
 
 		 429 aa  47.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  22.36 
 
 		 455 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0788  putative mRNA 3-end processing factor  24.74 
 
 		 317 aa  47.8  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  24.39 
 
 		 455 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  24.8 
 
 		 467 aa  47.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  27.65 
 
 		 642 aa  47.4  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  24.39 
 
 		 455 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  29.94 
 
 		 428 aa  47  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  22.25 
 
 		 644 aa  47  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 		 460 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2046  hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily-like  24.35 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.419381  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  26.35 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.41 
 
 		 470 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  23.68 
 
 		 397 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.09 
 
 		 490 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.83 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  26.77 
 
 		 452 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  22.55 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  23.87 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.86 
 
 		 460 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  24.6 
 
 		 461 aa  45.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  23.87 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  23.38 
 
 		 634 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  25.58 
 
 		 462 aa  44.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  19.76 
 
 		 1017 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  26.88 
 
 		 484 aa  44.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2716  beta-lactamase domain protein  25.54 
 
 		 481 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.521064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  28.74 
 
 		 637 aa  44.3  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1406  RNA procession exonuclease-like protein  25.42 
 
 		 313 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0847473 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  21.55 
 
 		 452 aa  43.9  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4186  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 		 545 aa  43.9  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  22.16 
 
 		 631 aa  43.5  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0019  beta-lactamase-like protein  24.05 
 
 		 813 aa  43.5  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  22.61 
 
 		 646 aa  43.5  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00437  DNA repair protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04570)  34.94 
 
 		 845 aa  43.5  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.775561  normal  0.182643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>