14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_17702 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_17702  predicted protein  100 
 
 
411 aa  854    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.257016 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01200  expressed protein  26.58 
 
 
758 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32290  predicted protein  29.07 
 
 
684 aa  86.7  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40815  predicted protein  26.67 
 
 
182 aa  78.2  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0533421  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44277  predicted protein  23.86 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10962  interstrand crosslink repair protein (Eurofung)  27.78 
 
 
832 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04070  conserved hypothetical protein  28.49 
 
 
811 aa  58.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.96924  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00437  DNA repair protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04570)  39.66 
 
 
845 aa  53.5  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.775561  normal  0.182643 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56782  predicted protein  25.43 
 
 
628 aa  51.2  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47094  predicted protein  26.45 
 
 
503 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_3060  predicted protein  22.53 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.206644  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  28.36 
 
 
821 aa  43.5  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  30.16 
 
 
452 aa  43.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0788  putative mRNA 3-end processing factor  27.45 
 
 
317 aa  43.1  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>