101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41615 on replicon NC_011700
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011700  PHATRDRAFT_41615  predicted protein  100 
 
 
386 aa  796    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44043  predicted protein  34.62 
 
 
348 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.198797  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  27.4 
 
 
566 aa  58.9  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09098  conserved hypothetical protein  34.51 
 
 
352 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000689737  normal  0.411917 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45331  predicted protein  40.85 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0689578  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35002  predicted protein  36.04 
 
 
302 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353104  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5006  predicted protein  38.98 
 
 
270 aa  53.9  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895863  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.25 
 
 
306 aa  53.1  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54329  Putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase of the seven beta-strand family  28.57 
 
 
296 aa  53.1  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.103283  hitchhiker  0.00259781 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  28 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.58 
 
 
306 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16816  predicted protein  38.81 
 
 
669 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000655212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  28.19 
 
 
219 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1665  ribosomal L11 methyltransferase  42.11 
 
 
264 aa  50.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  28.19 
 
 
219 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  28.19 
 
 
219 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  28.19 
 
 
219 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  27.88 
 
 
264 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1738  ribosomal L11 methyltransferase  40.98 
 
 
264 aa  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36186  predicted protein  29.38 
 
 
249 aa  49.7  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  24.16 
 
 
240 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.53 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  31.03 
 
 
215 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41150  predicted protein  33.02 
 
 
347 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04470  hypothetical protein  32.84 
 
 
349 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0131065  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15961  predicted protein  50 
 
 
1080 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0299  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  48.15 
 
 
189 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.56429  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  27.66 
 
 
229 aa  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  28.44 
 
 
300 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.19 
 
 
307 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07290  conserved hypothetical protein  27.22 
 
 
250 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  27.04 
 
 
246 aa  47.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39038  predicted protein  30.83 
 
 
289 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.4 
 
 
308 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28521  predicted protein  25.45 
 
 
229 aa  47  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17089  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03851  conserved hypothetical protein  32.67 
 
 
356 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355606  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  33.33 
 
 
299 aa  46.6  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  27.7 
 
 
307 aa  46.6  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  28.46 
 
 
219 aa  46.6  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32772  predicted protein  25.77 
 
 
371 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4431  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.71 
 
 
312 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00225658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  38.55 
 
 
198 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  28.9 
 
 
244 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.67 
 
 
290 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1491  ribosomal protein L11 methyltransferase  48.89 
 
 
307 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  31.82 
 
 
338 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0983  FkbM family methyltransferase  50 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171365  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0187  ribosomal L11 methyltransferase  30.09 
 
 
258 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4163  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.97 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000153463  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1724  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.69 
 
 
327 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  25.85 
 
 
246 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  33.63 
 
 
210 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10134  glucose-inducible SAM-dependent methyltransferase Rrg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16310)  28.41 
 
 
354 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.54 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  26.71 
 
 
231 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0136  ribosomal L11 methyltransferase  36.36 
 
 
214 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000366624  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  25.56 
 
 
217 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.54 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1100  ribosomal L11 methyltransferase  36.99 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.441785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.48 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  30.28 
 
 
235 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  30 
 
 
285 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1753  methyltransferase small  39.68 
 
 
226 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335045 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02500  Putative nicotinamide N-methyltransferase (EC 2.1.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAD0]  24.14 
 
 
262 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00380138  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  25.62 
 
 
217 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.98 
 
 
251 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  30.63 
 
 
239 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  36.14 
 
 
418 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3038  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.35 
 
 
312 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000244532  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2169  methyltransferase small  40 
 
 
202 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1657  ribosomal L11 methyltransferase  43.4 
 
 
247 aa  44.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.94 
 
 
316 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  35.16 
 
 
566 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4211  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.44 
 
 
312 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000228671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4049  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.44 
 
 
312 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0005166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4059  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.44 
 
 
312 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000479623  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  23.86 
 
 
217 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4537  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.44 
 
 
312 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  41.67 
 
 
196 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4445  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.44 
 
 
312 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000232951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4334  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.44 
 
 
312 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.10013e-48 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  27.68 
 
 
218 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0935  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.38 
 
 
291 aa  43.5  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199402  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  30.43 
 
 
202 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  25.96 
 
 
233 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44159  predicted protein  37.68 
 
 
305 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0065862  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.18 
 
 
313 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02290  arginine N-methyltransferase 3, putative  38.6 
 
 
596 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  25.75 
 
 
221 aa  43.5  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1845  methyltransferase small  38.71 
 
 
203 aa  43.5  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  35.29 
 
 
208 aa  43.5  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0805  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.44 
 
 
312 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000461178  decreased coverage  1.14716e-22 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0569  modification methylase, HemK family  30.77 
 
 
267 aa  43.5  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1412  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.85 
 
 
444 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0859  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.75 
 
 
293 aa  43.1  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236714  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0163  16S RNA G1207 methylase  31.36 
 
 
218 aa  43.1  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1798  methyltransferase small  41.18 
 
 
203 aa  43.1  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.397225  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.73 
 
 
300 aa  42.7  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30928  predicted protein  31.19 
 
 
169 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0895  methylase  30.43 
 
 
202 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>