More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1933 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1933  50S ribosomal protein L22  100 
 
 		 116 aa  237  4e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0392  50S ribosomal protein L22  65.79 
 
 		 137 aa  150  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05740  50S ribosomal protein L22  64.91 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244087  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0607  ribosomal protein L22  66.67 
 
 		 120 aa  148  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.886368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1152  50S ribosomal protein L22  61.95 
 
 		 136 aa  148  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000795738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5782  ribosomal protein L22  60.55 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4348  ribosomal protein L22  60.75 
 
 		 124 aa  137  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000469697  normal  0.116233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1620  ribosomal protein L22  61.47 
 
 		 119 aa  134  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3157  50S ribosomal protein L22P  56.07 
 
 		 182 aa  130  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2291  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  normal  0.0100692 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1846  50S ribosomal protein L22  56.76 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.38308  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2059  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000104467  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0294  50S ribosomal protein L22  53.15 
 
 		 119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0186  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000360961  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2418  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103689  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2224  50S ribosomal protein L22  48.67 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000069218  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0399  50S ribosomal protein L22  51.43 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0374  50S ribosomal protein L22  51.43 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  46.73 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  52.58 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  51.89 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  44.55 
 
 		 281 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  51.55 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  49.06 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 120 aa  90.9  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  46.3 
 
 		 133 aa  90.1  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0965  50S ribosomal protein L22  51.43 
 
 		 110 aa  90.1  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00314246  hitchhiker  0.00000114714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  49.52 
 
 		 111 aa  90.1  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  46.67 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  50.52 
 
 		 110 aa  90.1  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  44.76 
 
 		 111 aa  89.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0502  50S ribosomal protein L22  43.81 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195927  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  49.06 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  43.4 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0332  50S ribosomal protein L22  43.81 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  44.76 
 
 		 111 aa  89.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  45.79 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04516  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 111 aa  88.6  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000201226  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  45.37 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  45.28 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  47.37 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  45.28 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  44.86 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  48.6 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000490323  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  48.6 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  48.6 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  42.45 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  46.23 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  44.34 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  46.23 
 
 		 110 aa  87.4  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 		 110 aa  87  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2164  ribosomal protein L22  49.06 
 
 		 112 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.135391 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  43.4 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  44.66 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  44.66 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  44.66 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  44.66 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  44.66 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  44.66 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  50.52 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  44.95 
 
 		 111 aa  86.7  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2367  ribosomal protein L22  46.23 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.414165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  44.66 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  47 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0494  50S ribosomal protein L22  47.62 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000320971  hitchhiker  0.00360456 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  44.86 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  44.66 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0691  50S ribosomal protein L22  49.52 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  38.32 
 
 		 121 aa  85.9  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0489  50S ribosomal protein L22  47.62 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  44.66 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  43.64 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  44.66 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3519  ribosomal protein L22  45.92 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000743779  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  48.11 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>